Bacteroidetes

Bacteroidetes

Cultivo de Bacteroides sp..
Clasificación científica
Dominio: Bacteria
Filo: Bacteroidetes
Clases
  • Bifissio spartinae ♠ Xin & Zhou 2001
  • ‘Candidatus Amoebophilus’Horn et al. 2001
  • ‘Candidatus Cardinium’ Zchori-Fein et al. 2004
  • ‘Candidatus Paenicardinium’ Noel and Atibalentja 2006
  • Toxothrix ♪ Molisch 1925
  • Venteria ♠ Bae 2005
  • Bacteroidia Krieg 2012
    • Bacteroidales Krieg 2012
      • ‘Candidatus Armantifilum’ Desai et al. 2010
      • ‘Candidatus Azobacteroides’
      • ‘Candidatus Symbiothrix’ Hongoh et al. 2007
      • ‘Candidatus Vestibaculum’ Stingl et al. 2004
      • Sunxiuqinia Qu et al. 2011
      • Bacteroidaceae Pribram 1933
      • Marinilabiaceae Ludwig et al. 2012
      • Porphyromonadaceae Krieg 2012
      • Prevotellaceae Krieg 2012
      • Rikenellaceae Krieg et al. 2012
  • Cytophagia Nakagawa 2012
    • Cytophagales Leadbetter 1974
      • Cyclobacteriaceae Nedashkovskaya and Ludwig 2012
      • Cytophagaceae Stanier 1940
      • Flammeovirgaceae Yoon et al. 2011
      • Rhodothermaceae Ludwig et al. 2012
  • Flavobacteriia Bernardet 2012
    • Flavobacteriales Bernardet 2012
      • Blattabacteriaceae Kambhampati 2012
      • Cryomorphaceae Bowman et al. 2003
      • Flavobacteriaceae Reichenbach et al. 1992 emend. Bernardet et al. 2002
      • Schleiferiaceae Albuquerque et al. 2011
  • Sphingobacteria Kämpfer 2012
    • Sphingobacteriales Kämpfer 2012
      • Chitinophagaceae Kämpfer et al. 2011
      • Saprospiraceae Krieg et al. 2012
      • Sphingobacteriaceae Steyn et al. 1998

As Bacteroidetes (sinónimo Bacteroidota) son un filo de bacterias composto por tres grandes clases de bacterias gramnegativas, non formadoras de esporas, anaeróbicas, e con forma de bacilos, que están amplamente distribuídas no ambiente, e que aarecen no solo, sedimentos, mares e nos intestinos e pel dos animais.

Con diferenza, a clase Bacteroidia é a mellor estudada deste filo, e inclúe os xéneros Bacteroides (un organismo abundante nas feces dos animais de sangue quente, incluídos os humanos), e Porphyromonas, que habitan na cavidade bucal humana. A clase actual Bacteroidia antes foi chamada formalmente Bacteroidetes xa que ata hai pouco era a única clase do filo (nese caso coinciden os nomes do filo e a clase), pero o nome foi cambiado no cuarto volume do Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.[1]

Membros do xénero Bacteroides son patóxenos oportunistas. Os membros das outras dúas clases raramente son patóxenos para os humanos.

O investigador Jeffrey Gordon e os seus colegas descubriron que os homes e os rtos obesos tiñan unha flora intestinal cunha baixa porcentaxe de Bacteroidetes e relativamente maior cantidade de bacterias do grupo Firmicutes. Porén, non están seguros se os Bacteroidetes preveñen a obesidade ou se esta flora intestinal é simplemente seleccionada preferencialmente nas condicións intestinais dos que non están obesos.[2][3][4]

Este filo agrúpase ás veces con Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadetes, Caldithrix e o grupo mariño A para formar o grupo FCB ou superfilo. Na clasificación alternativa proposta por Cavalier-Smith, este taxon é unha clase do filo Sphingobacteria.

Filoxenia

Véxase tamén: Taxonomía bacteriana.

No cladograma móstrase a toxonomía actualmente aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [5] e no NCBI (National Center for Biotechnology Information) [6] e a filoxenia está baseada en datos do ARNr 16S do LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree.[7]

 
 

?Bifissio spartinae ♠ Xin & Zhou 2001

 
 

?‘Candidatus Amoebophilus asiaticus’Horn et al. 2001

 
 

?‘Candidatus Cardinium hertigii’ Zchori-Fein et al. 2004

 
 

?‘Candidatus Paenicardinium endonii’ Noel e Atibalentja 2006

 
 

?Toxothrix trichogenes ♪ (Cholodny 1924) Beger 1953

 
 

?Venteria marina ♠ Bae 2005

 
 

Rhodothermaceae

 
 
 

Balneola-Gracilimonas clade

 
 
 

Thermonema clade

 
 
 

Flammeovirgaceae

 
 
  Cytophagales
 

Reichenbachiella Nedashkovskaya et al. 2005 emend. Cha et al. 2011

 
 
 

Flammeovirgaceae 2 [incl. Ekhidna lutea]

 
 
 

Marivirga Nedashkovskaya et al. 2010

 
 
 

Cyclobacteriaceae [incl. Rhodonellum psychrophilum]

 
 

Cytophagaceae

 
 
 
 
 
 
 
 

Saprospiraceae

 
 

Chitinophagaceae

 
 
 
 

Sphingobacteriaceae

 
 
  Flavobacteriales
 

?'Candidatus Sulcia muelleri' Moran et al. 2005

 
 

?'Candidatus Uzinura diaspidicola' Gruwell et al. 2007

 
 

?Schleiferia thermophila Albuquerque et al. 2011 {Schleiferiaceae}

 
 

?Blattabacteriaceae

 
 

Cryomorphaceae 2

 
 

Flavobacteriaceae

 
 
 
 

Cryomorphaceae 1

 
  Bacteroidales
 

?‘Candidatus Armantifilum devescovinae’ Desai et al. 2010

 
 

?‘Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae’

 
 

?‘Candidatus Symbiothrix dinenymphae’ Hongoh et al. 2007

 
 

?‘Candidatus Vestibaculum illigatum’ Stingl et al. 2004

 
 

?Marinilabilia salmonicolor (Veldkamp 1961) Nakagawa e Yamasato 1996 emend. Suzuki et al. 1999

 
 

?Sunxiuqinia elliptica Qu et al. 2011

 
 
 
 

Meniscus glaucopis Irgens 1977

 
 

Prolixibacter bellariavorans Holmes et al. 2007

 
 
 

Rikenellaceae

 
 
 
 
 

Cytophaga fermentans Bachmann 1955

 
 

Marinifilum fragile Na et al. 2009

 
 
 
 

Alkaliflexus imshenetskii Zhilina et al. 2005

 
 
 

Anaerophaga thermohalophila Denger et al. 2002

 
 
 

Porphyromonadaceae 2

 
 
 

Porphyromonadaceae 3

 
 
 

Porphyromonadaceae 1

 
 
 

Porphyromonadaceae 4

 
 
 

Porphyromonadaceae 5

 
 

Bacteroidaceae [incl. Prevotellaceae]

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Notas
♠ Liñaxes atopadas no NCBI pero non na LPSN.
♪ Procariotas dos que non hai cultivos puros (axénicos) illados ou dispoñibles, porque non se poden cultivar ou duran pouco.

Notas

  1. ↑ Krieg, N.R.; Ludwig, W.; Whitman, W.B.; Hedlund, B.P.; Paster, B.J.; Staley, J.T.; Ward, N.; Brown, D.; Parte, A. (November 24, 2010) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity, ed. The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (en English) 4 (2nd ed.). New York: Springer. p. 908. ISBN 978-0-387-95042-6. British Library no. GBA561951. 
  2. ↑ Ley R, Bäckhed F, Turnbaugh P, Lozupone C, Knight R, Gordon J (2005). "Obesity alters gut microbial ecology". Proc Natl Acad Sci USA 102 (31): 11070–5. PMC 1176910. PMID 16033867. doi:10.1073/pnas.0504978102. 
  3. ↑ Ley R, Turnbaugh P, Klein S, Gordon J (2006). "Microbial ecology: human gut microbes associated with obesity". Nature 444 (7122): 1022–3. PMID 17183309. doi:10.1038/4441022a. 
  4. ↑ Turnbaugh P, Ley R, Mahowald M, Magrini V, Mardis E, Gordon J (2006). "An obesity-associated gut microbiome with increased capacity for energy harvest". Nature 444 (7122): 1027–31. PMID 17183312. doi:10.1038/nature05414. 
  5. ↑ J.P. Euzéby. "Bacteroidetes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. Arquivado dende o orixinal o 13 de xuño de 2011. Consultado o 4 xullo 2012. 
  6. ↑ Sayers; et al. "Bacteroidetes". National Center for Biotechnology Information. Consultado o 4 xullo 2012. 
  7. ↑ 'The All-Species Living Tree' Project."16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Arquivado dende o orixinal (PDF) o 07 de maio de 2012. Consultado o 2011-11-17. 

Véxase tamén

Ligazóns externas