Kodon

Kodon je niz triju nukleotida koji se nalazi na molekuli glasničke RNK. Određuje položaj određene aminokiseline u procesu sinteze bjelančevina[1] u stanici, čime djeluju kao jedinica genetičkoga kodiranja. Ovi su nukleotidi uzastopni.[2] Svaka trojka nukleotida prepisana s DNK na glasničku RNK naziva se kodon ili kod[3] i predstavlja osnovnu jedinicu genskog koda.[4]
Kodone u procesima sinteze bjelančevina dijelimo na:[2]
- početni kodon: AUG – kodira aminokiselinu metionin, koja označava početak stvaranja polipeptidnoga lanca
- završni kodon (STOP-kodon), koji označava kraj stvaranja polipeptidnoga lanca, ali ne kodira ni jednu aminokiselinu jer mu ne postoji ni jedan komplementarni antikodon. Postoje 3 poznata STOP-kodona: UAG, UAA i UGA (za RNK), te TAG, TAA i TAG (za DNK).
Tablica translacije
| Biokemijska svojstva aminokiselina | Nepolarna |
Polarna |
Bazična |
Kisela ↓ | Kraj: stop kodon |
Standardna tablica RNA kodona
| Prvi nukleotid | Drugi nukleotid | Treći nukleotid | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| U | C | A | G | ||||||
| U | UUU | (Phe/F) Fenilalanin |
UCU | (Ser/S) Serin |
UAU | (Tyr/Y) Tirozin |
UGU | (Cys/C) Cistein |
U |
| UUC | UCC | UAC | UGC | C | |||||
| UUA | (Leu/L) Leucin |
UCA | UAA | Stop | UGA | Stop | A | ||
| UUG | UCG | UAG | Stop | UGG | (Trp/W) Triptofan |
G | |||
| C | CUU | CCU | (Pro/P) Prolin |
CAU | (His/H) Histidin |
CGU | (Arg/R) Arginin |
U | |
| CUC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
| CUA | CCA | CAA | (Gln/Q) Glutamin |
CGA | A | ||||
| CUG | CCG | CAG | CGG | G | |||||
| A | AUU | (Ile/I) Izoleucin |
ACU | (Thr/T) Treonin |
AAU | (Asn/N) Asparagin |
AGU | (Ser/S) Serin |
U |
| AUC | ACC | AAC | AGC | C | |||||
| AUA | ACA | AAA | (Lys/K) Lizin |
AGA | (Arg/R) Arginin |
A | |||
| AUG | (Met/M) Metionin |
ACG | AAG | AGG | G | ||||
| G | GUU | (Val/V) Valin |
GCU | (Ala/A) Alanin |
GAU | (Asp/D) Asparaginska kiselina ↓ | GGU | (Gly/G) Glicin |
U |
| GUC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
| GUA | GCA | GAA | (Glu/E) Glutaminska kiselina ↓ | GGA | A | ||||
| GUG | GCG | GAG | GGG | G | |||||
Inverzna tablica RNA kodona
| Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Ala, A | GCU, GCC, GCA, GCG | GCN | Ile, I | AUU, AUC, AUA | AUH | |
| Arg, R | CGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; ili CGY, MGR |
Leu, L | CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUG | CUN, UUR; ili CUY, YUR | |
| Asn, N | AAU, AAC | AAY | Lys, K | AAA, AAG | AAR | |
| Asp, D | GAU, GAC | GAY | Met, M | AUG | ||
| Asn ili Asp, B | AAU, AAC; GAU, GAC | RAY | Phe, F | UUU, UUC | UUY | |
| Cys, C | UGU, UGC | UGY | Pro, P | CCU, CCC, CCA, CCG | CCN | |
| Gln, Q | CAA, CAG | CAR | Ser, S | UCU, UCC, UCA, UCG; AGU, AGC | UCN, AGY | |
| Glu, E | GAA, GAG | GAR | Thr, T | ACU, ACC, ACA, ACG | ACN | |
| Gln ili Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | SAR | Trp, W | UGG | ||
| Gly, G | GGU, GGC, GGA, GGG | GGN | Tyr, Y | UAU, UAC | UAY | |
| His, H | CAU, CAC | CAY | Val, V | GUU, GUC, GUA, GUG | GUN | |
| START | AUG | STOP | UAA, UGA, UAG | URA, UAR | ||
Standardna tablica DNA kodona
| Prvi nukleotid | Drugi nukleotid | Treći nukleotid | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| T | C | A | G | ||||||
| T | TTT | (Phe/F) Fenilalanin |
TCT | (Ser/S) Serin |
TAT | (Tyr/Y) Tirozin |
TGT | (Cys/C) Cistein |
T |
| TTC | TCC | TAC | TGC | C | |||||
| TTA | (Leu/L) Leucin |
TCA | TAA | Stop | TGA | Stop | A | ||
| TTG | TCG | TAG | Stop | TGG | (Trp/W) Triptofan |
G | |||
| C | CTT | CCT | (Pro/P) Prolin |
CAT | (His/H) Histidin |
CGT | (Arg/R) Arginin |
T | |
| CTC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
| CTA | CCA | CAA | (Gln/Q) Glutamin |
CGA | A | ||||
| CTG | CCG | CAG | CGG | G | |||||
| A | ATT | (Ile/I) Izoleucin |
ACT | (Thr/T) Treonin |
AAT | (Asn/N) Asparagin |
AGT | (Ser/S) Serin |
T |
| ATC | ACC | AAC | AGC | C | |||||
| ATA | ACA | AAA | (Lys/K) Lizin |
AGA | (Arg/R) Arginin |
A | |||
| ATG | (Met/M) Metionin |
ACG | AAG | AGG | G | ||||
| G | GTT | (Val/V) Valin |
GCT | (Ala/A) Alanin |
GAT | (Asp/D) Asparaginska kiselina ↓ | GGT | (Gly/G) Glicin |
T |
| GTC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
| GTA | GCA | GAA | (Glu/E) Glutaminska kiselina ↓ | GGA | A | ||||
| GTG | GCG | GAG | GGG | G | |||||
Inverzna tablica DNA kodona
| Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Ala, A | GCT, GCC, GCA, GCG | GCN | Ile, I | ATT, ATC, ATA | ATH | |
| Arg, R | CGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; ili CGY, MGR |
Leu, L | CTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTG | CTN, TTR; ili CTY, YTR | |
| Asn, N | AAT, AAC | AAY | Lys, K | AAA, AAG | AAR | |
| Asp, D | GAT, GAC | GAY | Met, M | ATG | ||
| Asn ili Asp, B | AAT, AAC; GAT, GAC | RAY | Phe, F | TTT, TTC | TTY | |
| Cys, C | TGT, TGC | TGY | Pro, P | CCT, CCC, CCA, CCG | CCN | |
| Gln, Q | CAA, CAG | CAR | Ser, S | TCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGC | TCN, AGY | |
| Glu, E | GAA, GAG | GAR | Thr, T | ACT, ACC, ACA, ACG | ACN | |
| Gln ili Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | SAR | Trp, W | TGG | ||
| Gly, G | GGT, GGC, GGA, GGG | GGN | Tyr, Y | TAT, TAC | TAY | |
| His, H | CAT, CAC | CAY | Val, V | GTT, GTC, GTA, GTG | GTN | |
| START | ATG | STOP | TAA, TGA, TAG | TRA, TAR | ||
Vidi
- Genska uputa (genski kod)
- Genska karta
Bilješke
- ↑ Glavna razlika između DNA i RNA je da je DNA baza timin (T) unutar RNA zamijenjena uracilom (U). To je jedina razlika u tablicama DNA i RNA kodona
Izvori
- ↑ Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne Arhivirana inačica izvorne stranice od 21. rujna 2016. (Wayback Machine) (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 68
- ↑ a b kodon. Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. Pristupljeno 26. veljače 2015.
- ↑ Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne Arhivirana inačica izvorne stranice od 21. rujna 2016. (Wayback Machine) (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 46-47
- ↑ genski kôd. Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. Pristupljeno 26. veljače 2015.
- ↑ Amino Acid Translation Table. Oregon State University. Inačica izvorne stranice arhivirana 29. svibnja 2020. Pristupljeno 2. prosinca 2020.
- ↑ The Information in DNA Determines Cellular Function via Translation. Scitable. Nature. Inačica izvorne stranice arhivirana 23. rujna 2017. Pristupljeno 5. prosinca 2020.
- ↑ a b IUPAC—IUB Commission on Biochemical Nomenclature. Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and Their Constituents (PDF). International Union of Pure and Applied Chemistry. Pristupljeno 5. prosinca 2020.
- ↑ Genes. DNA, Genetics, and Evolution. Boston University. Inačica izvorne stranice arhivirana 28. travnja 2020. Pristupljeno 10. prosinca 2020.