Emeka Eneli ha giocato nel settore giovanile del Columbus Crew dal 2012 al 2017 per poi giocare, dopo un anno all'Ohio Premier, con il Cornell Big Red nel periodo di frequentazione della Cornell University.[2] In quegli anni ha giocato anche alcuni incontri in USL League Two nel 2019 con il Lionsbridge[3] e nel 2022 con il Flint City Bucks.[4]
Divenuto eleggibile per il SuperDraft del 2023, il 24 marzo è stato selezionato dal Real Salt Lake.[5] Due giorni dopo ha debuttato in prima squadra giocando titolare nell'incontro di MLS perso 4-0 contro il St. Louis City.[6]