ATG9A

ATG9A
Ідентифікатори
Символи	ATG9A, APG9L1, MGD3208, mATG9, autophagy related 9A
Зовнішні ІД	OMIM: 612204 MGI: 2138446 HomoloGene: 34495 GeneCards: ATG9A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • recycling endosome; • ендосома; • late endosome; • комплекс Ґольджі; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • late endosome membrane; • phagophore assembly site; • trans-Golgi network; • autophagosome membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • autophagosome; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • cytoplasmic vesicle membrane;
Біологічний процес	• protein localization to phagophore assembly site; • autophagosome assembly; • автофагія; • autophagy of mitochondrion; • late nucleophagy; • protein transport; • response to nutrient levels; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79065
	245860
	ENSG00000198925
	ENSMUSG00000033124
	Q7Z3C6
	Q68FE2
	NM_001077198; NM_024085
	NM_001003917; NM_001288612; NM_001288613
	NP_001070666; NP_076990; NP_001070666.1; NP_076990.4
NP_001003917; NP_001275541; NP_001275542; NP_001395154; NP_001395156;
	NP_001395158; NP_001395159; NP_001395160
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATG9A (англ. Autophagy related 9A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 94 447^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQFDTEYQR	LEASYSDSPP	GEEDLLVHVA	EGSKSPWHHI	ENLDLFFSRV
YNLHQKNGFT	CMLIGEIFEL	MQFLFVVAFT	TFLVSCVDYD	ILFANKMVNH
SLHPTEPVKV	TLPDAFLPAQ	VCSARIQENG	SLITILVIAG	VFWIHRLIKF
IYNICCYWEI	HSFYLHALRI	PMSALPYCTW	QEVQARIVQT	QKEHQICIHK
RELTELDIYH	RILRFQNYMV	ALVNKSLLPL	RFRLPGLGEA	VFFTRGLKYN
FELILFWGPG	SLFLNEWSLK	AEYKRGGQRL	ELAQRLSNRI	LWIGIANFLL
CPLILIWQIL	YAFFSYAEVL	KREPGALGAR	CWSLYGRCYL	RHFNELEHEL
QSRLNRGYKP	ASKYMNCFLS	PLLTLLAKNG	AFFAGSILAV	LIALTIYDED
VLAVEHVLTT	VTLLGVTVTV	CRSFIPDQHM	VFCPEQLLRV	ILAHIHYMPD
HWQGNAHRSQ	TRDEFAQLFQ	YKAVFILEEL	LSPIVTPLIL	IFCLRPRALE
IIDFFRNFTV	EVVGVGDTCS	FAQMDVRQHG	HPQWLSAGQT	EASVYQQAED
GKTELSLMHF	AITNPGWQPP	RESTAFLGFL	KEQVQRDGAA	ASLAQGGLLP
ENALFTSIQS	LQSESEPLSL	IANVVAGSSC	RGPPLPRDLQ	GSRHRAEVAS
ALRSFSPLQP	GQAPTGRAHS	TMTGSGVDAR	TASSGSSVWE	GQLQSLVLSE
YASTEMSLHA	LYMHQLHKQQ	AQAEPERHVW	HRRESDESGE	SAPDEGGEGA
RAPQSIPRSA	SYPCAAPRPG	APETTALHGG	FQRRYGGITD	PGTVPRVPSH
FSRLPLGGWA	EDGQSASRHP	EPVPEEGSED	ELPPQVHKV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, автофагія, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chan E.Y.W., Longatti A., McKnight N.C., Tooze S.A. (2009). Kinase-inactivated ULK proteins inhibit autophagy via their conserved C-terminal domains using an Atg13-independent mechanism. Mol. Cell. Biol. 29: 157—171. PMID 18936157 DOI:10.1128/MCB.01082-08
Webber J.L., Tooze S.A. (2010). Coordinated regulation of autophagy by p38alpha MAPK through mAtg9 and p38IP. EMBO J. 29: 27—40. PMID 19893488 DOI:10.1038/emboj.2009.321
Tamura H., Shibata M., Koike M., Sasaki M., Uchiyama Y. (2010). Atg9A protein, an autophagy-related membrane protein, is localized in the neurons of mouse brains. J. Histochem. Cytochem. 58: 443—453. PMID 20124090 DOI:10.1369/jhc.2010.955690

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22408 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 29 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q7Z3C6 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22408 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 29 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q7Z3C6 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]