BRF1

BRF1
Ідентифікатори
Символи	BRF1, BRF, BRF-1, GTF3B, HEL-S-76p, TAF3B2, TAF3C, TAFIII90, TF3B90, TFIIIB90, hBRF, CFDS, RNA polymerase III transcription initiation factor 90 kDa subunit, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, BRF1 RNA polymerase III transcription initiation factor subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 604902 MGI: 1919558 HomoloGene: 1161 GeneCards: BRF1
Пов'язані генетичні захворювання
	cerebellar-facial-dental syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• TBP-class protein binding; • зв'язування з іоном металу; • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity; • RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • translation initiation factor activity;
Клітинна компонента	• transcription factor TFIIIB complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• rRNA transcription; • tRNA transcription; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase III; • transcription by RNA polymerase III; • transcription initiation from RNA polymerase III promoter; • transcription preinitiation complex assembly; • DNA-templated transcription, initiation; • RNA polymerase III preinitiation complex assembly; • regulation of transcription by RNA polymerase III; • translational initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2972
	72308
	ENSG00000185024
	ENSMUSG00000011158
	Q92994
	Q8CFK2
NM_001242786; NM_001242787; NM_001242788; NM_001242789; NM_001242790;
	NM_001519; NM_145685; NM_145696
	NM_028193
NP_001229715; NP_001229716; NP_001229717; NP_001229718; NP_001229719;
	NP_001510; NP_663718; NP_663718.1
	NP_082469
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

BRF1 (англ. BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 677 амінокислот, а молекулярна маса — 73 840^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTGRVCRGCG	GTDIELDAAR	GDAVCTACGS	VLEDNIIVSE	VQFVESSGGG
SSAVGQFVSL	DGAGKTPTLG	GGFHVNLGKE	SRAQTLQNGR	RHIHHLGNQL
QLNQHCLDTA	FNFFKMAVSR	HLTRGRKMAH	VIAACLYLVC	RTEGTPHMLL
DLSDLLQVNV	YVLGKTFLLL	ARELCINAPA	IDPCLYIPRF	AHLLEFGEKN
HEVSMTALRL	LQRMKRDWMH	TGRRPSGLCG	AALLVAARMH	DFRRTVKEVI
SVVKVCESTL	RKRLTEFEDT	PTSQLTIDEF	MKIDLEEECD	PPSYTAGQRK
LRMKQLEQVL	SKKLEEVEGE	ISSYQDAIEI	ELENSRPKAK	GGLASLAKDG
STEDTASSLC	GEEDTEDEEL	EAAASHLNKD	LYRELLGGAP	GSSEAAGSPE
WGGRPPALGS	LLDPLPTAAS	LGISDSIREC	ISSQSSDPKD	ASGDGELDLS
GIDDLEIDRY	ILNESEARVK	AELWMRENAE	YLREQREKEA	RIAKEKELGI
YKEHKPKKSC	KRREPIQAST	AREAIEKMLE	QKKISSKINY	SVLRGLSSAG
GGSPHREDAQ	PEHSASARKL	SRRRTPASRS	GADPVTSVGK	RLRPLVSTQP
AKKVATGEAL	LPSSPTLGAE	PARPQAVLVE	SGPVSYHADE	EADEEEPDEE
DGEPCVSALQ	MMGSNDYGCD	GDEDDGY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Wang Z., Roeder R.G. (1995). Structure and function of a human transcription factor TFIIIB subunit that is evolutionarily conserved and contains both TFIIB- and high-mobility-group protein 2-related domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 7026—7030. PMID 7624363 doi:10.1073/pnas.92.15.7026
Mital R., Kobayashi R., Hernandez N. (1996). RNA polymerase III transcription from the human U6 and adenovirus type 2 VAI promoters has different requirements for human BRF, a subunit of human TFIIIB. Mol. Cell. Biol. 16: 7031—7042. PMID 8943358 doi:10.1128/MCB.16.12.7031
McCulloch V., Hardin P., Peng W., Ruppert J.M., Lobo-Ruppert S.M. (2000). Alternatively spliced hBRF variants function at different RNA polymerase III promoters. EMBO J. 19: 4134—4143. PMID 10921893 doi:10.1093/emboj/19.15.4134
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Fairley J.A., Scott P.H., White R.J. (2003). TFIIIB is phosphorylated, disrupted and selectively released from tRNA promoters during mitosis in vivo. EMBO J. 22: 5841—5850. PMID 14592981 doi:10.1093/emboj/cdg544