CBX5

CBX5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3FDT, 3I3C
Ідентифікатори
Символи	CBX5, HEL25, HP1, HP1A, chromobox 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604478 MGI: 109372 HomoloGene: 7257 GeneCards: CBX5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein-macromolecule adaptor activity; • chromatin binding; • histone deacetylase binding; • methylated histone binding; • ribonucleoprotein complex binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• кінетохор; • клітинне ядро; • nuclear envelope; • pericentric heterochromatin; • ядерце; • histone deacetylase complex; • нуклеоплазма; • chromocenter; • GO:0035328 Гетерохроматин; • центромера; • histone methyltransferase complex; • transcription repressor complex; • хромосома; • PML body; • GO:0009327 protein-containing complex; • Рибонуклеопротеїни; • site of DNA damage;
Біологічний процес	• зсідання крові; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0022415 viral process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of G0 to G1 transition; • cellular response to DNA damage stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23468
	12419
	ENSG00000094916
	ENSMUSG00000009575
	P45973
	Q61686
	NM_012117; NM_001127321; NM_001127322
	NM_001076789; NM_001110216; NM_007626; NM_001358950
	NP_001120793; NP_001120794; NP_036249
	NP_001070257; NP_001103686; NP_031652; NP_001345879
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CBX5 (англ. Chromobox 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 191 амінокислот, а молекулярна маса — 22 225^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKKTKRTAD	SSSSEDEEEY	VVEKVLDRRV	VKGQVEYLLK	WKGFSEEHNT
WEPEKNLDCP	ELISEFMKKY	KKMKEGENNK	PREKSESNKR	KSNFSNSADD
IKSKKKREQS	NDIARGFERG	LEPEKIIGAT	DSCGDLMFLM	KWKDTDEADL
VLAKEANVKC	PQIVIAFYEE	RLTWHAYPED	AENKEKETAK	S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ye Q., Worman H.J. (1996). Interaction between an integral protein of the nuclear envelope inner membrane and human chromodomain proteins homologous to Drosophila HP1. J. Biol. Chem. 271: 14653—14656. PMID 8663349 doi:10.1074/jbc.271.25.14653
Ye Q., Callebaut I., Pezhman A., Courvalin J.-C., Worman H.J. (1997). Domain-specific interactions of human HP1-type chromodomain proteins and inner nuclear membrane protein LBR. J. Biol. Chem. 272: 14983—14989. PMID 9169472 doi:10.1074/jbc.272.23.14983
Minc E., Allory Y., Worman H.J., Courvalin J.-C., Buendia B. (1999). Localization and phosphorylation of HP1 proteins during the cell cycle in mammalian cells. Chromosoma. 108: 220—234. PMID 10460410 doi:10.1007/s004120050372
Lachner M., O'Carroll D., Rea S., Mechtler K., Jenuwein T. (2001). Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins. Nature. 410: 116—120. PMID 11242053 doi:10.1038/35065132
Lechner M.S., Schultz D.C., Negorev D., Maul G.G., Rauscher F.J. III (2005). The mammalian heterochromatin protein 1 binds diverse nuclear proteins through a common motif that targets the chromoshadow domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 331: 929—937. PMID 15882967 doi:10.1016/j.bbrc.2005.04.016

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1555 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P45973 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1555 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P45973 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]