CDHR2

CDHR2
Ідентифікатори
Символи	CDHR2, PCDH24, PCLKC, cadherin related family member 2, PCLCK
Зовнішні ІД	MGI: 2687323 HomoloGene: 134510 GeneCards: CDHR2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • spanning component of plasma membrane; • brush border membrane; • міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • екзосома; • apical plasma membrane; • brush border; • мембрана; • cell projection; • microvillus membrane;
Біологічний процес	• адгезія клітин; • epithelial cell differentiation; • regulation of microvillus length; • negative regulation of cell growth involved in contact inhibition; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • intermicrovillar adhesion; • диференціація клітин; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	54825
	268663
	ENSG00000074276
	ENSMUSG00000034918
	Q9BYE9
	E9Q7P9
	NM_001171976; NM_017675
	NM_001033364
	NP_001165447; NP_060145
	NP_001028536
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDHR2 (англ. Cadherin related family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 310 амінокислот, а молекулярна маса — 141 543^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQLWLSCFL	LPALVVSVAA	NVAPKFLANM	TSVILPEDLP	VGAQAFWLVA
EDQDNDPLTY	GMSGPNAYFF	AVTPKTGEVK	LASALDYETL	YTFKVTISVS
DPYIQVQREM	LVIVEDRNDN	APVFQNTAFS	TSINETLPVG	SVVFSVLAVD
KDMGSAGMVV	YSIEKVIPST	GDSEHLFRIL	ANGSIVLNGS	LSYNNKSAFY
QLELKACDLG	GMYHNTFTIQ	CSLPVFLSIS	VVDQPDLDPQ	FVREFYSASV
AEDAAKGTSV	LTVEAVDGDK	GINDPVIYSI	SYSTRPGWFD	IGADGVIRVN
GSLDREQLLE	ADEEVQLQVT	ATETHLNIYG	QEAKVSIWVT	VRVMDVNDHK
PEFYNCSLPA	CTFTPEEAQV	NFTGYVDEHA	SPRIPIDDLT	MVVYDPDKGS
NGTFLLSLGG	PDAEAFSVSP	ERAVGSASVQ	VLVRVSALVD	YERQTAMAVQ
VVATDSVSQN	FSVAMVTIHL	RDINDHRPTF	PQSLYVLTVP	EHSATGSVVT
DSIHATDPDT	GAWGQITYSL	LPGNGADLFQ	VDPVSGTVTV	RNGELLDRES
QAVYYLTLQA	TDGGNLSSST	TLQIHLLDIN	DNAPVVSGSY	NIFVQEEEGN
VSVTIQAHDN	DEPGTNNSRL	LFNLLPGPYS	HNFSLDPDTG	LLRNLGPLDR
EAIDPALEGR	IVLTVLVSDC	GEPVLGTKVN	VTITVEDIND	NLPIFNQSSY
NFTVKEEDPG	VLVGVVKAWD	ADQTEANNRI	SFSLSGSGAN	YFMIRGLVLG
AGWAEGYLRL	PPDVSLDYET	QPVFNLTVSA	ENPDPQGGET	IVDVCVNVKD
VNDNPPTLDV	ASLRGIRVAE	NGSQHGQVAV	VVASDVDTSA	QLEIQLVNIL
CTKAGVDVGS	LCWGWFSVAA	NGSVYINQSK	AIDYEACDLV	TLVVRACDLA
TDPGFQAYSN	NGSLLITIED	VNDNAPYFLP	ENKTFVIIPE	LVLPNREVAS
VRARDDDSGN	NGVILFSILR	VDFISKDGAT	IPFQGVFSIF	TSSEADVFAG
SIQPVTSLDS	TLQGTYQVTV	QARDRPSLGP	FLEATTTLNL	FTVDQSYRSR
LQFSTPKEEV	GANRQAINAA	LTQATRTTVY	IVDIQDIDSA	ARARPHSYLD
AYFVFPNGSA	LTLDELSVMI	RNDQDSLTQL	LQLGLVVLGS	QESQESDLSK
QLISVIIGLG	VALLLVLVIM	TMAFVCVRKS	YNRKLQAMKA	AKEARKTAAG
VMPSAPAIPG	TNMYNTERAN	PMLNLPNKDL	GLEYLSPSND	LDSVSVNSLD
DNSVDVDKNS	QEIKEHRPPH	TPPEPDPEPL	SVVLLGRQAG	ASGQLEGPSY
TNAGLDTTDL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, диференціація клітин, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Okazaki N., Takahashi N., Kojima S., Masuho Y., Koga H. (2002). Protocadherin LKC, a new candidate for a tumor suppressor of colon and liver cancers, its association with contact inhibition of cell proliferation. Carcinogenesis. 23: 1139—1148. PMID 12117771 doi:10.1093/carcin/23.7.1139
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Yang L.Y., Wang W., Peng J.X., Yang J.Q., Huang G.W. (2004). Differentially expressed genes between solitary large hepatocellular carcinoma and nodular hepatocellular carcinoma. World J. Gastroenterol. 10: 3569—3573. PMID 15534908 doi:10.3748/wjg.v10.i24.3569
Li J., He Y., Lu Q., Zhang M. (2016). Mechanistic basis of organization of the Harmonin/USH1C-mediated brush border microvilli tip-link complex. Dev. Cell. 36: 179—189. PMID 26812017 doi:10.1016/j.devcel.2015.12.020
Crawley S.W., Weck M.L., Grega-Larson N.E., Shifrin D.A. Jr., Tyska M.J. (2016). ANKS4B is essential for intermicrovillar adhesion complex formation. Dev. Cell. 36: 190—200. PMID 26812018 doi:10.1016/j.devcel.2015.12.022

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18231 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9BYE9 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18231 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9BYE9 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]