CHD2

CHD2
Ідентифікатори
Символи	CHD2, EEOC, chromodomain helicase DNA binding protein 2, DEE94
Зовнішні ІД	OMIM: 602119 MGI: 2448567 HomoloGene: 37462 GeneCards: CHD2
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічний лімфолейкоз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0004003 DNA helicase activity; • GO:0031493 histone binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • RNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • нуклеоплазма; • ядерце; • екзосома; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • muscle organ development; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • hematopoietic stem cell differentiation; • DNA duplex unwinding; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1106
	244059
	ENSG00000173575
	ENSMUSG00000078671
	O14647
	E9PZM4
	NM_001271; NM_001042572
	NM_001081345
	NP_001036037; NP_001262
	NP_001074814
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHD2 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 828 амінокислот, а молекулярна маса — 211 344^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMRNKDKSQE	EDSSLHSNAS	SHSASEEASG	SDSGSQSESE	QGSDPGSGHG
SESNSSSESS	ESQSESESES	AGSKSQPVLP	EAKEKPASKK	ERIADVKKMW
EEYPDVYGVR	RSNRSRQEPS	RFNIKEEASS	GSESGSPKRR	GQRQLKKQEK
WKQEPSEDEQ	EQGTSAESEP	EQKKVKARRP	VPRRTVPKPR	VKKQPKTQRG
KRKKQDSSDE	DDDDDEAPKR	QTRRRAAKNV	SYKEDDDFET	DSDDLIEMTG
EGVDEQQDNS	ETIEKVLDSR	LGKKGATGAS	TTVYAIEANG	DPSGDFDTEK
DEGEIQYLIK	WKGWSYIHST	WESEESLQQQ	KVKGLKKLEN	FKKKEDEIKQ
WLGKVSPEDV	EYFNCQQELA	SELNKQYQIV	ERVIAVKTSK	STLGQTDFPA
HSRKPAPSNE	PEYLCKWMGL	PYSECSWEDE	ALIGKKFQNC	IDSFHSRNNS
KTIPTRECKA	LKQRPRFVAL	KKQPAYLGGE	NLELRDYQLE	GLNWLAHSWC
KNNSVILADE	MGLGKTIQTI	SFLSYLFHQH	QLYGPFLIVV	PLSTLTSWQR
EFEIWAPEIN	VVVYIGDLMS	RNTIREYEWI	HSQTKRLKFN	ALITTYEILL
KDKTVLGSIN	WAFLGVDEAH	RLKNDDSLLY	KTLIDFKSNH	RLLITGTPLQ
NSLKELWSLL	HFIMPEKFEF	WEDFEEDHGK	GRENGYQSLH	KVLEPFLLRR
VKKDVEKSLP	AKVEQILRVE	MSALQKQYYK	WILTRNYKAL	AKGTRGSTSG
FLNIVMELKK	CCNHCYLIKP	PEENERENGQ	EILLSLIRSS	GKLILLDKLL
TRLRERGNRV	LIFSQMVRML	DILAEYLTIK	HYPFQRLDGS	IKGEIRKQAL
DHFNADGSED	FCFLLSTRAG	GLGINLASAD	TVVIFDSDWN	PQNDLQAQAR
AHRIGQKKQV	NIYRLVTKGT	VEEEIIERAK	KKMVLDHLVI	QRMDTTGRTI
LENNSGRSNS	NPFNKEELTA	ILKFGAEDLF	KELEGEESEP	QEMDIDEILR
LAETRENEVS	TSATDELLSQ	FKVANFATME	DEEELEERPH	KDWDEIIPEE
QRKKVEEEER	QKELEEIYML	PRIRSSTKKA	QTNDSDSDTE	SKRQAQRSSA
SESETEDSDD	DKKPKRRGRP	RSVRKDLVEG	FTDAEIRRFI	KAYKKFGLPL
ERLECIARDA	ELVDKSVADL	KRLGELIHNS	CVSAMQEYEE	QLKENASEGK
GPGKRRGPTI	KISGVQVNVK	SIIQHEEEFE	MLHKSIPVDP	EEKKKYCLTC
RVKAAHFDVE	WGVEDDSRLL	LGIYEHGYGN	WELIKTDPEL	KLTDKILPVE
TDKKPQGKQL	QTRADYLLKL	LRKGLEKKGA	VTGGEEAKLK	KRKPRVKKEN
KVPRLKEEHG	IELSSPRHSD	NPSEEGEVKD	DGLEKSPMKK	KQKKKENKEN
KEKQMSSRKD	KEGDKERKKS	KDKKEKPKSG	DAKSSSKSKR	SQGPVHITAG
SEPVPIGEDE	DDDLDQETFS	ICKERMRPVK	KALKQLDKPD	KGLNVQEQLE
HTRNCLLKIG	DRIAECLKAY	SDQEHIKLWR	RNLWIFVSKF	TEFDARKLHK
LYKMAHKKRS	QEEEEQKKKD	DVTGGKKPFR	PEASGSSRDS	LISQSHTSHN
LHPQKPHLPA	SHGPQMHGHP	RDNYNHPNKR	HFSNADRGDW	QRERKFNYGG
GNNNPPWGSD	RHHQYEQHWY	KDHHYGDRRH	MDAHRSGSYR	PNNMSRKRPY
DQYSSDRDHR	GHRDYYDRHH	HDSKRRRSDE	FRPQNYHQQD	FRRMSDHRPA
MGYHGQGPSD	HYRSFHTDKL	GEYKQPLPPL	HPAVSDPRSP	PSQKSPHDSK
SPLDHRSPLE	RSLEQKNNPD	YNWNVRKT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, міогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Woodage T., Basrai M.A., Baxevanis A.D., Hieter P., Collins F.S. (1997). Characterization of the CHD family of proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 11472—11477. PMID 9326634 doi:10.1073/pnas.94.21.11472
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504