DDX41

DDX41
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2P6N, 5GVR, 5H1Y, 5GVS, 8C6J
Ідентифікатори
Символи	DDX41, ABS, MPLPF, DEAD-box helicase 41
Зовнішні ІД	OMIM: 608170 MGI: 1920185 HomoloGene: 9431 GeneCards: DDX41
Пов'язані генетичні захворювання
	DDX41-related hematologic malignancy predisposition syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • GO:0008026 helicase activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • catalytic step 2 spliceosome; • мембрана; • ендоплазматичний ретикулум; • клітинне ядро; • spliceosomal complex; • ядерце; • цитоплазма;
Біологічний процес	• cellular response to interferon-beta; • mRNA processing; • regulation of type I interferon production; • defense response to virus; • RNA secondary structure unwinding; • Сплайсинг РНК; • positive regulation of type I interferon production; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0097285 апоптоз; • mRNA splicing, via spliceosome; • проліферація; • диференціація клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51428
	72935
	ENSG00000183258
	ENSMUSG00000021494
	Q9UJV9
	Q91VN6
	NM_016222; NM_001321732; NM_001321830
	NM_134059
	NP_001308661; NP_001308759; NP_057306
	NP_598820
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DDX41 (англ. DEAD-box helicase 41) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 622 амінокислот, а молекулярна маса — 69 838^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEESEPERKR	ARTDEVPAGG	SRSEAEDEDD	EDYVPYVPLR	QRRQLLLQKL
LQRRRKGAAE	EEQQDSGSEP	RGDEDDIPLG	PQSNVSLLDQ	HQHLKEKAEA
RKESAKEKQL	KEEEKILESV	AEGRALMSVK	EMAKGITYDD	PIKTSWTPPR
YVLSMSEERH	ERVRKKYHIL	VEGDGIPPPI	KSFKEMKFPA	AILRGLKKKG
IHHPTPIQIQ	GIPTILSGRD	MIGIAFTGSG	KTLVFTLPVI	MFCLEQEKRL
PFSKREGPYG	LIICPSRELA	RQTHGILEYY	CRLLQEDSSP	LLRCALCIGG
MSVKEQMETI	RHGVHMMVAT	PGRLMDLLQK	KMVSLDICRY	LALDEADRMI
DMGFEGDIRT	IFSYFKGQRQ	TLLFSATMPK	KIQNFAKSAL	VKPVTINVGR
AGAASLDVIQ	EVEYVKEEAK	MVYLLECLQK	TPPPVLIFAE	KKADVDAIHE
YLLLKGVEAV	AIHGGKDQEE	RTKAIEAFRE	GKKDVLVATD	VASKGLDFPA
IQHVINYDMP	EEIENYVHRI	GRTGRSGNTG	IATTFINKAC	DESVLMDLKA
LLLEAKQKVP	PVLQVLHCGD	ESMLDIGGER	GCAFCGGLGH	RITDCPKLEA
MQTKQVSNIG	RKDYLAHSSM	DF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Irion U., Leptin M. (1999). Developmental and cell biological functions of the Drosophila DEAD-box protein abstrakt. Curr. Biol. 9: 1373—1381. PMID 10607561 DOI:10.1016/S0960-9822(00)80082-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088