DFFA

DFFA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IBX, 1IYR, 1KOY
Ідентифікатори
Символи	DFFA, DFF-45, DFF1, ICAD, DNA fragmentation factor subunit alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 601882 MGI: 1196227 HomoloGene: 3240 GeneCards: DFFA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein domain specific binding; • білки, що розгортають шаперонну активність; • deoxyribonuclease inhibitor activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • lipid droplet; • внутрішньоклітинний; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• positive regulation of apoptotic process; • negative regulation of execution phase of apoptosis; • negative regulation of apoptotic DNA fragmentation; • apoptotic DNA fragmentation; • thymocyte apoptotic process; • GO:0097285 апоптоз; • negative regulation of deoxyribonuclease activity; • chaperone-mediated protein folding;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1676
	13347
	ENSG00000160049
	ENSMUSG00000028974
	O00273
	O54786
	NM_213566; NM_004401
	NM_001025296; NM_010044
	NP_004392; NP_998731; NP_998731.1
	NP_001020467; NP_034174
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DFFA (англ. DNA fragmentation factor subunit alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 331 амінокислот, а молекулярна маса — 36 522^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVTGDAGVP	ESGEIRTLKP	CLLRRNYSRE	QHGVAASCLE	DLRSKACDIL
AIDKSLTPVT	LVLAEDGTIV	DDDDYFLCLP	SNTKFVALAS	NEKWAYNNSD
GGTAWISQES	FDVDETDSGA	GLKWKNVARQ	LKEDLSSIIL	LSEEDLQMLV
DAPCSDLAQE	LRQSCATVQR	LQHTLQQVLD	QREEVRQSKQ	LLQLYLQALE
KEGSLLSKQE	ESKAAFGEEV	DAVDTGISRE	TSSDVALASH	ILTALREKQA
PELSLSSQDL	ELVTKEDPKA	LAVALNWDIK	KTETVQEACE	RELALRLQQT
QSLHSLRSIS	ASKASPPGDL	QNPKRARQDP	T

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, ацетиляція. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Liu X., Zou H., Slaughter C., Wang X. (1997). DFF, a heterodimeric protein that functions downstream of caspase-3 to trigger DNA fragmentation during apoptosis. Cell. 89: 175—184. PMID 9108473 doi:10.1016/S0092-8674(00)80197-X
Oh J.J., Grosshans D.R., Wong S.G., Slamon D.J. (1999). Identification of differentially expressed genes associated with HER-2/neu overexpression in human breast cancer cells. Nucleic Acids Res. 27: 4008—4017. PMID 10497265 doi:10.1093/nar/27.20.4008
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Zhou P., Lugovskoy A.A., McCarty J.S., Li P., Wagner G. (2001). Solution structure of DFF40 and DFF45 N-terminal domain complex and mutual chaperone activity of DFF40 and DFF45. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 6051—6055. PMID 11371636 doi:10.1073/pnas.111145098

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2772 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O00273 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2772 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O00273 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]