HCFC1

HCFC1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи HCFC1, CFF, HCF-1, HCF1, HFC1, MRX3, PPP1R89, VCAF, HCF, Host cell factor C1, XLID3, MAHCX
Зовнішні ІД OMIM: 300019 MGI: 105942 HomoloGene: 3898 GeneCards: HCFC1
Пов'язані генетичні захворювання
methylmalonic acidemia with homocystinuria, type cblX[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_005334
NM_008224
RefSeq (білок)
NP_005325
NP_032250
Локус (UCSC) Хр. X: 153.95 – 153.97 Mb Хр. X: 72.99 – 73.01 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HCFC1 (англ. Host cell factor C1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 035 амінокислот, а молекулярна маса — 208 732[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MASAVSPANLPAVLLQPRWKRVVGWSGPVPRPRHGHRAVAIKELIVVFGG
GNEGIVDELHVYNTATNQWFIPAVRGDIPPGCAAYGFVCDGTRLLVFGGM
VEYGKYSNDLYELQASRWEWKRLKAKTPKNGPPPCPRLGHSFSLVGNKCY
LFGGLANDSEDPKNNIPRYLNDLYILELRPGSGVVAWDIPITYGVLPPPR
ESHTAVVYTEKDNKKSKLVIYGGMSGCRLGDLWTLDIDTLTWNKPSLSGV
APLPRSLHSATTIGNKMYVFGGWVPLVMDDVKVATHEKEWKCTNTLACLN
LDTMAWETILMDTLEDNIPRARAGHCAVAINTRLYIWSGRDGYRKAWNNQ
VCCKDLWYLETEKPPPPARVQLVRANTNSLEVSWGAVATADSYLLQLQKY
DIPATAATATSPTPNPVPSVPANPPKSPAPAAAAPAVQPLTQVGITLLPQ
AAPAPPTTTTIQVLPTVPGSSISVPTAARTQGVPAVLKVTGPQATTGTPL
VTMRPASQAGKAPVTVTSLPAGVRMVVPTQSAQGTVIGSSPQMSGMAALA
AAAAATQKIPPSSAPTVLSVPAGTTIVKTMAVTPGTTTLPATVKVASSPV
MVSNPATRMLKTAAAQVGTSVSSATNTSTRPIITVHKSGTVTVAQQAQVV
TTVVGGVTKTITLVKSPISVPGGSALISNLGKVMSVVQTKPVQTSAVTGQ
ASTGPVTQIIQTKGPLPAGTILKLVTSADGKPTTIITTTQASGAGTKPTI
LGISSVSPSTTKPGTTTIIKTIPMSAIITQAGATGVTSSPGIKSPITIIT
TKVMTSGTGAPAKIITAVPKIATGHGQQGVTQVVLKGAPGQPGTILRTVP
MGGVRLVTPVTVSAVKPAVTTLVVKGTTGVTTLGTVTGTVSTSLAGAGGH
STSASLATPITTLGTIATLSSQVINPTAITVSAAQTTLTAAGGLTTPTIT
MQPVSQPTQVTLITAPSGVEAQPVHDLPVSILASPTTEQPTATVTIADSG
QGDVQPGTVTLVCSNPPCETHETGTTNTATTTVVANLGGHPQPTQVQFVC
DRQEAAASLVTSTVGQQNGSVVRVCSNPPCETHETGTTNTATTATSNMAG
QHGCSNPPCETHETGTTNTATTAMSSVGANHQRDARRACAAGTPAVIRIS
VATGALEAAQGSKSQCQTRQTSATSTTMTVMATGAPCSAGPLLGPSMARE
PGGRSPAFVQLAPLSSKVRLSSPSIKDLPAGRHSHAVSTAAMTRSSVGAG
EPRMAPVCESLQGGSPSTTVTVTALEALLCPSATVTQVCSNPPCETHETG
TTNTATTSNAGSAQRVCSNPPCETHETGTTHTATTATSNGGTGQPEGGQQ
PPAGRPCETHQTTSTGTTMSVSVGALLPDATSSHRTVESGLEVAAAPSVT
PQAGTALLAPFPTQRVCSNPPCETHETGTTHTATTVTSNMSSNQDPPPAA
SDQGEVESTQGDSVNITSSSAITTTVSSTLTRAVTTVTQSTPVPGPSVPP
PEELQVSPGPRQQLPPRQLLQSASTALMGESAEVLSASQTPELPAAVDLS
STGEPSSGQESAGSAVVATVVVQPPPPTQSEVDQLSLPQELMAEAQAGTT
TLMVTGLTPEELAVTAAAEAAAQAAATEEAQALAIQAVLQAAQQAVMGTG
EPMDTSEAAATVTQAELGHLSAEGQEGQATTIPIVLTQQELAALVQQQQL
QEAQAQQQHHHLPTEALAPADSLNDPAIESNCLNELAGTVPSTVALLPST
ATESLAPSNTFVAPQPVVVASPAKLQAAATLTEVANGIESLGVKPDLPPP
PSKAPMKKENQWFDVGVIKGTNVMVTHYFLPPDDAVPSDDDLGTVPDYNQ
LKKQELQPGTAYKFRVAGINACGRGPFSEISAFKTCLPGFPGAPCAIKIS
KSPDGAHLTWEPPSVTSGKIIEYSVYLAIQSSQAGGELKSSTPAQLAFMR
VYCGPSPSCLVQSSSLSNAHIDYTTKPAIIFRIAARNEKGYGPATQVRWL
QETSKDSSGTKPANKRPMSSPEMKSAPKKSKADGQ

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з HCFC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4839 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-18 у Wayback Machine.]
  5. UniProt, P51610 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також