PRDM2

PRDM2
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JV0, 2QPW
Ідентифікатори
Символи	PRDM2, HUMHOXY1, KMT8, MTB-ZF, RIZ, RIZ1, RIZ2, PR domain 2, PR/SET domain 2, KMT8A
Зовнішні ІД	OMIM: 601196 MGI: 107628 HomoloGene: 40822 GeneCards: PRDM2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity; • transferase activity; • DNA binding; • zinc ion binding; • histone-lysine N-methyltransferase activity; • зв'язування з іоном металу; • nucleic acid binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • chromatin DNA binding; • sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • комплекс Ґольджі;
Біологічний процес	• histone lysine methylation; • Метилювання; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • determination of adult lifespan; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7799
	110593
	ENSG00000116731
	ENSMUSG00000057637
	Q13029
	н/д
NM_001007257; NM_001135610; NM_012231; NM_015866; NM_001393986;
	NM_001393987; NM_001393988
	NM_001081355; NM_001256380
	NP_001007258; NP_001129082; NP_036363; NP_056950
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRDM2 (англ. PR/SET domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 718 амінокислот, а молекулярна маса — 188 915^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNQNTTEPVA	ATETLAEVPE	HVLRGLPEEV	RLFPSAVDKT	RIGVWATKPI
LKGKKFGPFV	GDKKKRSQVK	NNVYMWEVYY	PNLGWMCIDA	TDPEKGNWLR
YVNWACSGEE	QNLFPLEINR	AIYYKTLKPI	APGEELLVWY	NGEDNPEIAA
AIEEERASAR	SKRSSPKSRK	GKKKSQENKN	KGNKIQDIQL	KTSEPDFTSA
NMRDSAEGPK	EDEEKPSASA	LEQPATLQEV	ASQEVPPELA	TPAPAWEPQP
EPDERLEAAA	CEVNDLGEEE	EEEEEEDEEE	EEDDDDDELE	DEGEEEASMP
NENSVKEPEI	RCDEKPEDLL	EEPKTTSEET	LEDCSEVTPA	MQIPRTKEEA
NGDVFETFMF	PCQHCERKFT	TKQGLERHMH	IHISTVNHAF	KCKYCGKAFG
TQINRRRHER	RHEAGLKRKP	SQTLQPSEDL	ADGKASGENV	ASKDDSSPPS
LGPDCLIMNS	EKASQDTINS	SVVEENGEVK	ELHPCKYCKK	VFGTHTNMRR
HQRRVHERHL	IPKGVRRKGG	LEEPQPPAEQ	AQATQNVYVP	STEPEEEGEA
DDVYIMDISS	NISENLNYYI	DGKIQTNNNT	SNCDVIEMES	ASADLYGINC
LLTPVTVEIT	QNIKTTQVPV	TEDLPKEPLG	STNSEAKKRR	TASPPALPKI
KAETDSDPMV	PSCSLSLPLS	ISTTEAVSFH	KEKSVYLSSK	LKQLLQTQDK
LTPAGISATE	IAKLGPVCVS	APASMLPVTS	SRFKRRTSSP	PSSPQHSPAL
RDFGKPSDGK	AAWTDAGLTS	KKSKLESHSD	SPAWSLSGRD	ERETVSPPCF
DEYKMSKEWT	ASSAFSSVCN	QQPLDLSSGV	KQKAEGTGKT	PVQWESVLDL
SVHKKHCSDS	EGKEFKESHS	VQPTCSAVKK	RKPTTCMLQK	VLLNEYNGID
LPVENPADGT	RSPSPCKSLE	AQPDPDLGPG	SGFPAPTVES	TPDVCPSSPA
LQTPSLSSGQ	LPPLLIPTDP	SSPPPCPPVL	TVATPPPPLL	PTVPLPAPSS
SASPHPCPSP	LSNATAQSPL	PILSPTVSPS	PSPIPPVEPL	MSAASPGPPT
LSSSSSSSSS	SSSFSSSSSS	SSPSPPPLSA	ISSVVSSGDN	LEASLPMISF
KQEELENEGL	KPREEPQSAA	EQDVVVQETF	NKNFVCNVCE	SPFLSIKDLT
KHLSIHAEEW	PFKCEFCVQL	FKDKTDLSEH	RFLLHGVGNI	FVCSVCKKEF
AFLCNLQQHQ	RDLHPDKVCT	HHEFESGTLR	PQNFTDPSKA	HVEHMQSLPE
DPLETSKEEE	ELNDSSEELY	TTIKIMASGI	KTKDPDVRLG	LNQHYPSFKP
PPFQYHHRNP	MGIGVTATNF	TTHNIPQTFT	TAIRCTKCGK	GVDNMPELHK
HILACASASD	KKRYTPKKNP	VPLKQTVQPK	NGVVVLDNSG	KNAFRRMGQP
KRLNFSVELS	KMSSNKLKLN	ALKKKNQLVQ	KAILQKNKSA	KQKADLKNAC
ESSSHICPYC	NREFTYIGSL	NKHAAFSCPK	KPLSPPKKKV	SHSSKKGGHS
SPASSDKNSN	SNHRRRTADA	EIKMQSMQTP	LGKTRARSSG	PTQVPLPSSS
FRSKQNVKFA	ASVKSKKPSS	SSLRNSSPIR	MAKITHVEGK	KPKAVAKNHS
AQLSSKTSRS	LHVRVQKSKA	VLQSKSTLAS	KKRTDRFNIK	SRERSGGPVT
RSLQLAAAAD	LSENKREDGS	AKQELKDFSY	SLRLASRCSP	PAAPYITRQY
RKVKAPAAAQ	FQGPFFKE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, s-аденозил-l-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

Buyse I.M., Shao G., Huang S. (1995). The retinoblastoma protein binds to RIZ, a zinc-finger protein that shares an epitope with the adenovirus E1A protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 4467—4471. PMID 7538672 DOI:10.1073/pnas.92.10.4467
Liu L., Shao G., Steele-Perkins G., Huang S. (1997). The retinoblastoma interacting zinc finger gene RIZ produces a PR domain-lacking product through an internal promoter. J. Biol. Chem. 272: 2984—2991. PMID 9006946 DOI:10.1074/jbc.272.5.2984
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shapiro V.S., Lee P., Winoto A. (1995). Identification and cloning of the G3B cDNA encoding a 3' segment of a protein binding to GATA-3. Gene. 163: 329—330. PMID 7590293 DOI:10.1016/0378-1119(95)00420-B
Muraosa Y., Takahashi K., Yoshizawa M., Shibahara S. (1996). cDNA cloning of a novel protein containing two zinc-finger domains that may function as a transcription factor for the human heme-oxygenase-1 gene. Eur. J. Biochem. 235: 471—479. PMID 8654390 DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.00471.x
Kim K.-C., Geng L., Huang S. (2003). Inactivation of a histone methyltransferase by mutations in human cancers. Cancer Res. 63: 7619—7623. PMID 14633678

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9347 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-24 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q13029 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9347 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-24 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q13029 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]