PRKRA

PRKRA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DIX
Ідентифікатори
Символи	PRKRA, DYT16, PACT, RAX, HSD14, protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2
Зовнішні ІД	OMIM: 603424 MGI: 1344375 HomoloGene: 2738 GeneCards: PRKRA
Пов'язані генетичні захворювання
	dystonia 16
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • enzyme binding; • double-stranded RNA binding; • GO:0010577 enzyme activator activity; • RNA binding; • pre-miRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • perinuclear region of cytoplasm; • гіалоплазма; • RISC-loading complex;
Біологічний процес	• skeletal system morphogenesis; • response to virus; • outer ear morphogenesis; • pre-miRNA processing; • protein phosphorylation; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • middle ear morphogenesis; • cellular response to oxidative stress; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • negative regulation of cell population proliferation; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • protein stabilization; • GO:0061715 miRNA metabolic process; • GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference; • Сайленсинг генів; • GO:0022415 viral process; • ear development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8575
	23992
	ENSG00000180228
	ENSMUSG00000002731
	O75569
	Q9WTX2
	NM_001139517; NM_001139518; NM_001316362; NM_003690
	NM_011871
	NP_001132989; NP_001132990; NP_001303291; NP_003681
	NP_036001
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRKRA (англ. Protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 404^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQSRHRAEA	PPLEREDSGT	FSLGKMITAK	PGKTPIQVLH	EYGMKTKNIP
VYECERSDVQ	IHVPTFTFRV	TVGDITCTGE	GTSKKLAKHR	AAEAAINILK
ANASICFAVP	DPLMPDPSKQ	PKNQLNPIGS	LQELAIHHGW	RLPEYTLSQE
GGPAHKREYT	TICRLESFME	TGKGASKKQA	KRNAAEKFLA	KFSNISPENH
ISLTNVVGHS	LGCTWHSLRN	SPGEKINLLK	RSLLSIPNTD	YIQLLSEIAK
EQGFNITYLD	IDELSANGQY	QCLAELSTSP	ITVCHGSGIS	CGNAQSDAAH
NALQYLKIIA	ERK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Patel R.C., Sen G.C. (1998). PACT, a protein activator of the interferon-induced protein kinase, PKR. EMBO J. 17: 4379—4390. PMID 9687506 doi:10.1093/emboj/17.15.4379
Ito T., Yang M., May W.S. (1999). RAX, a cellular activator for double-stranded RNA-dependent protein kinase during stress signaling. J. Biol. Chem. 274: 15427—15432. PMID 10336432 doi:10.1074/jbc.274.22.15427
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Peters G.A., Hartmann R., Qin J., Sen G.C. (2001). Modular structure of PACT: distinct domains for binding and activating PKR. Mol. Cell. Biol. 21: 1908—1920. PMID 11238927 doi:10.1128/MCB.21.6.1908-1920.2001
Peters G.A., Li S., Sen G.C. (2006). Phosphorylation of specific serine residues in the PKR activation domain of PACT is essential for its ability to mediate apoptosis. J. Biol. Chem. 281: 35129—35136. PMID 16982605 doi:10.1074/jbc.M607714200
Kok K.H., Ng M.-H., Ching Y.-P., Jin D.-Y. (2007). Human TRBP and PACT directly interact with each other and associate with dicer to facilitate the production of small interfering RNA. J. Biol. Chem. 282: 17649—17657. PMID 17452327 doi:10.1074/jbc.M611768200