RNF2

RNF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2H0D, 3GS2, 3H8H, 3IXS, 3RPG, 4R8P, 4S3O
Ідентифікатори
Символи	RNF2, BAP-1, BAP1, DING, HIPI3, RING1B, RING2, ring finger protein 2, ring1B, LUSYAM
Зовнішні ІД	OMIM: 608985 MGI: 1101759 HomoloGene: 2199 GeneCards: RNF2
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • chromatin binding; • RING-like zinc finger domain binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transferase activity; • zinc ion binding;
Клітинна компонента	• GO:0035327 Еухроматин; • sex chromatin; • ubiquitin ligase complex; • нуклеоплазма; • хромосома; • GO:0035328 Гетерохроматин; • MLL1 complex; • PRC1 complex; • PcG protein complex; • клітинне ядро; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• germ cell development; • histone H2A-K119 monoubiquitination; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • gastrulation with mouth forming second; • histone H2A monoubiquitination; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • transcription, DNA-templated; • Убіквітин-залежний протеоліз; • GO:0007067 мітоз; • anterior/posterior axis specification; • histone ubiquitination; • negative regulation of G0 to G1 transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6045
	19821
	ENSG00000121481
	ENSMUSG00000026484
	Q99496
	Q9CQJ4
	NM_007212
	NM_011277; NM_001360844; NM_001360845; NM_001360847
	NP_009143
	NP_035407; NP_001347773; NP_001347774; NP_001347776
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNF2 (англ. Ring finger protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 336 амінокислот, а молекулярна маса — 37 655^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSQAVQTNGT	QPLSKTWELS	LYELQRTPQE	AITDGLEIVV	SPRSLHSELM
CPICLDMLKN	TMTTKECLHR	FCADCIITAL	RSGNKECPTC	RKKLVSKRSL
RPDPNFDALI	SKIYPSRDEY	EAHQERVLAR	INKHNNQQAL	SHSIEEGLKI
QAMNRLQRGK	KQQIENGSGA	EDNGDSSHCS	NASTHSNQEA	GPSNKRTKTS
DDSGLELDNN	NAAMAIDPVM	DGASEIELVF	RPHPTLMEKD	DSAQTRYIKT
SGNATVDHLS	KYLAVRLALE	ELRSKGESNQ	MNLDTASEKQ	YTIYIATASG
QFTVLNGSFS	LELVSEKYWK	VNKPMELYYA	PTKEHK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ogawa H., Ishiguro K., Gaubatz S., Livingston D.M., Nakatani Y. (2002). A complex with chromatin modifiers that occupies E2F- and Myc-responsive genes in G0 cells. Science. 296: 1132—1136. PMID 12004135 doi:10.1126/science.1069861
Cao R., Tsukada Y., Zhang Y. (2005). Role of Bmi-1 and Ring1A in H2A ubiquitylation and Hox gene silencing. Mol. Cell. 20: 845—854. PMID 16359901 doi:10.1016/j.molcel.2005.12.002
Gearhart M.D., Corcoran C.M., Wamstad J.A., Bardwell V.J. (2006). Polycomb group and SCF ubiquitin ligases are found in a novel BCOR complex that is recruited to BCL6 targets. Mol. Cell. Biol. 26: 6880—6889. PMID 16943429 doi:10.1128/MCB.00630-06
Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 doi:10.1074/mcp.M110.002642