SUPT5H

SUPT5H
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DO3, 2E6Z, 2E70, 3H7H, 4L1U
Ідентифікатори
Символи	SUPT5H, SPT5, SPT5H, Tat-CT1, SPT5 homolog, DSIF elongation factor subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 602102 MGI: 1202400 HomoloGene: 2384 GeneCards: SUPT5H
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • enzyme binding; • chromatin binding; • RNA binding; • DNA binding; • mRNA binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • DSIF complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• ремоделювання хроматину; • negative regulation of mRNA polyadenylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • regulation of DNA-templated transcription, elongation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • response to organic substance; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of DNA-templated transcription, elongation; • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; • positive regulation of macroautophagy; • DNA-templated transcription, elongation; • single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate; • positive regulation of viral transcription; • клітинний цикл; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6829
	20924
	ENSG00000196235
	ENSMUSG00000003435
	O00267
	O55201
NM_001111020; NM_001130824; NM_001130825; NM_003169; NM_001319990;
	NM_001319991
	NM_013676
NP_001104490; NP_001124296; NP_001124297; NP_001306919; NP_001306920;
	NP_003160
	NP_038704
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SUPT5H (англ. SPT5 homolog, DSIF elongation factor subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 087 амінокислот, а молекулярна маса — 121 000^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDSEDSNFS	EEEDSERSSD	GEEAEVDEER	RSAAGSEKEE	EPEDEEEEEE
EEEYDEEEEE	EDDDRPPKKP	RHGGFILDEA	DVDDEYEDED	QWEDGAEDIL
EKEEIEASNI	DNVVLDEDRS	GARRLQNLWR	DQREEELGEY	YMKKYAKSSV
GETVYGGSDE	LSDDITQQQL	LPGVKDPNLW	TVKCKIGEER	ATAISLMRKF
IAYQFTDTPL	QIKSVVAPEH	VKGYIYVEAY	KQTHVKQAIE	GVGNLRLGYW
NQQMVPIKEM	TDVLKVVKEV	ANLKPKSWVR	LKRGIYKDDI	AQVDYVEPSQ
NTISLKMIPR	IDYDRIKARM	SLKDWFAKRK	KFKRPPQRLF	DAEKIRSLGG
DVASDGDFLI	FEGNRYSRKG	FLFKSFAMSA	VITEGVKPTL	SELEKFEDQP
EGIDLEVVTE	STGKEREHNF	QPGDNVEVCE	GELINLQGKI	LSVDGNKITI
MPKHEDLKDM	LEFPAQELRK	YFKMGDHVKV	IAGRFEGDTG	LIVRVEENFV
ILFSDLTMHE	LKVLPRDLQL	CSETASGVDV	GGQHEWGELV	QLDPQTVGVI
VRLERETFQV	LNMYGKVVTV	RHQAVTRKKD	NRFAVALDSE	QNNIHVKDIV
KVIDGPHSGR	EGEIRHLFRS	FAFLHCKKLV	ENGGMFVCKT	RHLVLAGGSK
PRDVTNFTVG	GFAPMSPRIS	SPMHPSAGGQ	RGGFGSPGGG	SGGMSRGRGR
RDNELIGQTV	RISQGPYKGY	IGVVKDATES	TARVELHSTC	QTISVDRQRL
TTVGSRRPGG	MTSTYGRTPM	YGSQTPMYGS	GSRTPMYGSQ	TPLQDGSRTP
HYGSQTPLHD	GSRTPAQSGA	WDPNNPNTPS	RAEEEYEYAF	DDEPTPSPQA
YGGTPNPQTP	GYPDPSSPQV	NPQYNPQTPG	TPAMYNTDQF	SPYAAPSPQG
SYQPSPSPQS	YHQVAPSPAG	YQNTHSPASY	HPTPSPMAYQ	ASPSPSPVGY
SPMTPGAPSP	GGYNPHTPGS	GIEQNSSDWV	TTDIQVKVRD	TYLDTQVVGQ
TGVIRSVTGG	MCSVYLKDSE	KVVSISSEHL	EPITPTKNNK	VKVILGEDRE
ATGVLLSIDG	EDGIVRMDLD	EQLKILNLRF	LGKLLEA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Stachora A.A., Schaefer R.E., Pohlmeier M., Maier G., Ponstingl H. (1997). Human Supt5h protein, a putative modulator of chromatin structure, is reversibly phosphorylated in mitosis. FEBS Lett. 409: 74—78. PMID 9199507 doi:10.1016/S0014-5793(97)00486-9
Wu-Baer F., Lane W.S., Gaynor R.B. (1998). Role of the human homolog of the yeast transcription factor SPT5 in HIV-1 Tat-activation. J. Mol. Biol. 277: 179—197. PMID 9514752 doi:10.1006/jmbi.1997.1601
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Watanabe D., Handa H. (1998). Evidence that P-TEFb alleviates the negative effect of DSIF on RNA polymerase II-dependent transcription in vitro. EMBO J. 17: 7395—7403. PMID 9857195 doi:10.1093/emboj/17.24.7395
Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 doi:10.1093/emboj/18.13.3688
Wen Y., Shatkin A.J. (1999). Transcription elongation factor hSPT5 stimulates mRNA capping. Genes Dev. 13: 1774—1779. PMID 10421630 doi:10.1101/gad.13.14.1774

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11469 (англ.) . Архів оригіналу за 6 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-06 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O00267 (англ.) . Архів оригіналу за 10 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11469 (англ.) . Архів оригіналу за 6 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-06 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O00267 (англ.) . Архів оригіналу за 10 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]