TFPT

TFPT
Ідентифікатори
Символи	TFPT, FB1, INO80F, amida, TCF3 (E2A) fusion partner (in childhood Leukemia), TCF3 fusion partner
Зовнішні ІД	OMIM: 609519 MGI: 1916964 HomoloGene: 8349 GeneCards: TFPT
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ядерна мембрана; • Ino80 complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• apoptotic signaling pathway; • GO:0097285 апоптоз; • DNA recombination; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0100026 Репарація ДНК; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • protein deubiquitination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	29844
	69714
ENSG00000275086; ENSG00000276504; ENSG00000274073; ENSG00000276022; ENSG00000276263;
	ENSG00000278161; ENSG00000105619; ENSG00000276296; ENSG00000276323; ENSG00000273833
	ENSMUSG00000006335
	P0C1Z6
	Q3U1J1
	NM_013342; NM_001321792
	NM_001290381; NM_023524
	NP_001308721; NP_037474; NP_001308721.1
	NP_001277310; NP_076013
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TFPT (англ. TCF3 fusion partner) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 253 амінокислот, а молекулярна маса — 28 278^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MELEQREGTM	AAVGFEEFSA	PPGSELALPP	LFGGHILESE	LETEVEFVSG
GLGGSGLRER	DEEEEAARGR	RRRQRELNRR	KYQALGRRCR	EIEQVNERVL
NRLHQVQRIT	RRLQQERRFL	MRVLDSYGDD	YRASQFTIVL	EDEGSQGTDA
PTPGNAENEP	PEKETLSPPR	RTPAPPEPGS	PAPGEGPSGR	KRRRVPRDGR
RAGNALTPEL	APVQIKVEED	FGFEADEALD	SSWVSRGPDK	LLPYPTLASP
ASD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Franchini C., Fontana F., Minuzzo M., Babbio F., Privitera E. (2006). Apoptosis promoted by up-regulation of TFPT (TCF3 fusion partner) appears p53 independent, cell type restricted and cell density influenced. Apoptosis. 11: 2217—2224. PMID 17041757 DOI:10.1007/s10495-006-0195-5