THOC1

THOC1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WXP
Ідентифікатори
Символи	THOC1, HPR1, P84, P84N5, THO complex 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606930 MGI: 1919668 HomoloGene: 38012 GeneCards: THOC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • transcription export complex; • nuclear matrix; • intercellular bridge; • THO complex; • THO complex part of transcription export complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck;
Біологічний процес	• regulation of DNA recombination; • mRNA transport; • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of DNA damage checkpoint; • mRNA processing; • regulation of DNA-templated transcription, elongation; • viral mRNA export from host cell nucleus; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; • negative regulation of isotype switching to IgA isotypes; • Сплайсинг РНК; • replication fork processing; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0097285 апоптоз; • RNA export from nucleus; • mRNA export from nucleus; • mRNA 3'-end processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9984
	225160
	ENSG00000079134
	ENSMUSG00000024287
	Q96FV9
	Q8R3N6
	NM_005131
	NM_153552
	NP_005122
	NP_705780
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

THOC1 (англ. THO complex 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 657 амінокислот, а молекулярна маса — 75 666^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSPTPPLFSL	PEARTRFTKS	TREALNNKNI	KPLLSTFSQV	PGSENEKKCT
LDQAFRGILE	EEIINHSSCE	NVLAIISLAI	GGVTEGICTA	STPFVLLGDV
LDCLPLDQCD	TIFTFVEKNV	ATWKSNTFYS	AGKNYLLRMC	NDLLRRLSKS
QNTVFCGRIQ	LFLARLFPLS	EKSGLNLQSQ	FNLENVTVFN	TNEQESTLGQ
KHTEDREEGM	DVEEGEMGDE	EAPTTCSIPI	DYNLYRKFWS	LQDYFRNPVQ
CYEKISWKTF	LKYSEEVLAV	FKSYKLDDTQ	ASRKKMEELK	TGGEHVYFAK
FLTSEKLMDL	QLSDSNFRRH	ILLQYLILFQ	YLKGQVKFKS	SNYVLTDEQS
LWIEDTTKSV	YQLLSENPPD	GERFSKMVEH	ILNTEENWNS	WKNEGCPSFV
KERTSDTKPT	RIIRKRTAPE	DFLGKGPTKK	ILMGNEELTR	LWNLCPDNME
ACKSETREHM	PTLEEFFEEA	IEQADPENMV	ENEYKAVNNS	NYGWRALRLL
ARRSPHFFQP	TNQQFKSLPE	YLENMVIKLA	KELPPPSEEI	KTGEDEDEED
NDALLKENES	PDVRRDKPVT	GEQIEVFANK	LGEQWKILAP	YLEMKDSEIR
QIECDSEDMK	MRAKQLLVAW	QDQEGVHATP	ENLINALNKS	GLSDLAESLT
NDNETNS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Durfee T., Mancini M.A., Jones D., Elledge S.J., Lee W.H. (1994). The amino-terminal region of the retinoblastoma gene product binds a novel nuclear matrix protein that co-localizes to centers for RNA processing. J. Cell Biol. 127: 609—622. PMID 7525595 doi:10.1083/jcb.127.3.609
Gasparri F., Sola F., Locatelli G., Muzio M. (2004). The death domain protein p84N5, but not the short isoform p84N5s, is cell cycle-regulated and shuttles between the nucleus and the cytoplasm. FEBS Lett. 574: 13—19. PMID 15358532 doi:10.1016/j.febslet.2004.07.074
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Doostzadeh-Cizeron J., Evans R., Yin S., Goodrich D.W. (1999). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is inhibited by association with Rb protein. Mol. Biol. Cell. 10: 3251—3261. PMID 10512864 doi:10.1091/mbc.10.10.3251
Doostzadeh-Cizeron J., Yin S., Goodrich D.W. (2000). Apoptosis induced by the nuclear death domain protein p84N5 is associated with caspase-6 and NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 275: 25336—25341. PMID 10840029 doi:10.1074/jbc.M000793200
Doostzadeh-Cizeron J., Terry N.H., Goodrich D.W. (2001). The nuclear death domain protein p84N5 activates a G2/M cell cycle checkpoint prior to the onset of apoptosis. J. Biol. Chem. 276: 1127—1132. PMID 11050087 doi:10.1074/jbc.M006944200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19070 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96FV9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19070 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q96FV9 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]