TIAM1

TIAM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D8I, 3KZD, 3KZE, 4GVC, 4GVD, 4K2O, 4K2P, 4NXP, 4NXQ, 4NXR
Ідентифікатори
Символи	TIAM1, T-cell lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1, T-cell lymphoma invasion and metastasis 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600687 MGI: 103306 HomoloGene: 2443 GeneCards: TIAM1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• microtubule binding; • kinase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • lipid binding; • guanyl-nucleotide exchange factor activity; • receptor tyrosine kinase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • cell-cell junction; • cell-cell contact zone; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинна мембрана; • dendritic spine; • axonal growth cone; • синапс; • main axon; • ruffle membrane; • міжклітинні контакти; • soma; • somatodendritic compartment; • мікротрубочка; • клітинне ядро; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • glutamatergic synapse; • extrinsic component of postsynaptic density membrane;
Біологічний процес	• protein localization to membrane; • GO:0097285 апоптоз; • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity; • positive regulation of JUN kinase activity; • ephrin receptor signaling pathway; • cardiac muscle hypertrophy; • regulation of non-canonical Wnt signaling pathway; • positive regulation of axonogenesis; • neuron projection extension; • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • regulation of dopaminergic neuron differentiation; • regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of neuron projection development; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of Schwann cell chemotaxis; • positive regulation of protein binding; • cell-matrix adhesion; • Rac protein signal transduction; • regulation of Rho protein signal transduction; • regulation of small GTPase mediated signal transduction; • cell migration; • positive regulation of dendritic spine morphogenesis; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • response to cocaine; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of cell migration; • NMDA selective glutamate receptor signaling pathway; • regulation of modification of postsynaptic actin cytoskeleton; • regulation of epithelial to mesenchymal transition; • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7074
	21844
	ENSG00000156299
	ENSMUSG00000002489
	Q13009
	Q60610
	NM_003253
	NM_001145886; NM_001145887; NM_009384
NP_003244; NP_001340613; NP_001340614; NP_001340615; NP_001340616;
	NP_001340617; NP_001340618; NP_001340619; NP_001340620; NP_001340621; NP_001340622; NP_001340623
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TIAM1 (англ. T-cell lymphoma invasion and metastasis 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 591 амінокислот, а молекулярна маса — 177 508^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGNAESQHVE	HEFYGEKHAS	LGRKHTSRSL	RLSHKTRRTR	HASSGKVIHR
NSEVSTRSSS	TPSIPQSLAE	NGLEPFSQDG	TLEDFGSPIW	VDRVDMGLRP
VSYTDSSVTP	SVDSSIVLTA	ASVQSMPDTE	ESRLYGDDAT	YLAEGGRRQH
SYTSNGPTFM	ETASFKKKRS	KSADIWREDS	LEFSLSDLSQ	EHLTSNEEIL
GSAEEKDCEE	ARGMETRASP	RQLSTCQRAN	SLGDLYAQKN	SGVTANGGPG
SKFAGYCRNL	VSDIPNLANH	KMPPAAAEET	PPYSNYNTLP	CRKSHCLSEG
ATNPQISHSN	SMQGRRAKTT	QDVNAGEGSE	FADSGIEGAT	TDTDLLSRRS
NATNSSYSPT	TGRAFVGSDS	GSSSTGDAAR	QGVYENFRRE	LEMSTTNSES
LEEAGSAHSD	EQSSGTLSSP	GQSDILLTAA	QGTVRKAGAL	AVKNFLVHKK
NKKVESATRR	KWKHYWVSLK	GCTLFFYESD	GRSGIDHNSI	PKHAVWVENS
IVQAVPEHPK	KDFVFCLSNS	LGDAFLFQTT	SQTELENWIT	AIHSACATAV
ARHHHKEDTL	RLLKSEIKKL	EQKIDMDEKM	KKMGEMQLSS	VTDSKKKKTI
LDQIFVWEQN	LEQFQMDLFR	FRCYLASLQG	GELPNPKRLL	AFASRPTKVA
MGRLGIFSVS	SFHALVAART	GETGVRRRTQ	AMSRSASKRR	SRFSSLWGLD
TTSKKKQGRP	SINQVFGEGT	EAVKKSLEGI	FDDIVPDGKR	EKEVVLPNVH
QHNPDCDIWV	HEYFTPSWFC	LPNNQPALTV	VRPGDTARDT	LELICKTHQL
DHSAHYLRLK	FLIENKMQLY	VPQPEEDIYE	LLYKEIEICP	KVTQSIHIEK
SDTAADTYGF	SLSSVEEDGI	RRLYVNSVKE	TGLASKKGLK	AGDEILEINN
RAADALNSSM	LKDFLSQPSL	GLLVRTYPEL	EEGVELLESP	PHRVDGPADL
GESPLAFLTS	NPGHSLCSEQ	GSSAETAPEE	TEGPDLESSD	ETDHSSKSTE
QVAAFCRSLH	EMNPSDQSPS	PQDSTGPQLA	TMRQLSDADK	LRKVICELLE
TERTYVKDLN	CLMERYLKPL	QKETFLTQDE	LDVLFGNLTE	MVEFQVEFLK
TLEDGVRLVP	DLEKLEKVDQ	FKKVLFSLGG	SFLYYADRFK	LYSAFCASHT
KVPKVLVKAK	TDTAFKAFLD	AQNPKQQHSS	TLESYLIKPI	QRILKYPLLL
RELFALTDAE	SEEHYHLDVA	IKTMNKVASH	INEMQKIHEE	FGAVFDQLIA
EQTGEKKEVA	DLSMGDLLLH	TTVIWLNPPA	SLGKWKKEPE	LAAFVFKTAV
VLVYKDGSKQ	KKKLVGSHRL	SIYEDWDPFR	FRHMIPTEAL	QVRALASADA
EANAVCEIVH	VKSESEGRPE	RVFHLCCSSP	ESRKDFLKAV	HSILRDKHRR
QLLKTESLPS	SQQYVPFGGK	RLCALKGARP	AMSRAVSAPS	KSLGRRRRRL
ARNRFTIDSD	AVSASSPEKE	SQQPPGGGDT	DRWVEEQFDL	AQYEEQDDIK
ETDILSDDDE	FCESVKGASV	DRDLQERLQA	TSISQRERGR	KTLDSHASRM
AQLKKQAALS	GINGGLESAS	EEVIWVRRED	FAPSRKLNTE	I

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Michiels F., Habets G.G.M., Stam J.C., van der Kammen R.A., Collard J.G. (1995). A role for Rac in Tiam1-induced membrane ruffling and invasion. Nature. 375: 338—340. PMID 7753201 doi:10.1038/375338a0
Connolly B.A., Rice J., Feig L.A., Buchsbaum R.J. (2005). Tiam1-IRSp53 complex formation directs specificity of rac-mediated actin cytoskeleton regulation. Mol. Cell. Biol. 25: 4602—4614. PMID 15899863 doi:10.1128/MCB.25.11.4602-4614.2005
Yoo S., Shin J., Park S. (2010). EphA8-ephrinA5 signaling and clathrin-mediated endocytosis is regulated by Tiam-1, a Rac-specific guanine nucleotide exchange factor. Mol. Cells. 29: 603—609. PMID 20496116 doi:10.1007/s10059-010-0075-2
Joshi M., Gakhar L., Fuentes E.J. (2013). High-resolution structure of the Tiam1 PHn-CC-Ex domain. Acta Crystallogr. F. 69: 744—752. PMID 23832200 doi:10.1107/S1744309113014206
Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 doi:10.1016/j.str.2013.01.004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11805 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13009 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11805 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q13009 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]