UBR5
UBR5 (англ. Ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 799 амінокислот, а молекулярна маса — 309 352[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MTSIHFVVHP | LPGTEDQLND | RLREVSEKLN | KYNLNSHPPL | NVLEQATIKQ | ||||
| CVVGPNHAAF | LLEDGRVCRI | GFSVQPDRLE | LGKPDNNDGS | KLNSNSGAGR | ||||
| TSRPGRTSDS | PWFLSGSETL | GRLAGNTLGS | RWSSGVGGSG | GGSSGRSSAG | ||||
| ARDSRRQTRV | IRTGRDRGSG | LLGSQPQPVI | PASVIPEELI | SQAQVVLQGK | ||||
| SRSVIIRELQ | RTNLDVNLAV | NNLLSRDDED | GDDGDDTASE | SYLPGEDLMS | ||||
| LLDADIHSAH | PSVIIDADAM | FSEDISYFGY | PSFRRSSLSR | LGSSRVLLLP | ||||
| LERDSELLRE | RESVLRLRER | RWLDGASFDN | ERGSTSKEGE | PNLDKKNTPV | ||||
| QSPVSLGEDL | QWWPDKDGTK | FICIGALYSE | LLAVSSKGEL | YQWKWSESEP | ||||
| YRNAQNPSLH | HPRATFLGLT | NEKIVLLSAN | SIRATVATEN | NKVATWVDET | ||||
| LSSVASKLEH | TAQTYSELQG | ERIVSLHCCA | LYTCAQLENS | LYWWGVVPFS | ||||
| QRKKMLEKAR | AKNKKPKSSA | GISSMPNITV | GTQVCLRNNP | LYHAGAVAFS | ||||
| ISAGIPKVGV | LMESVWNMND | SCRFQLRSPE | SLKNMEKASK | TTEAKPESKQ | ||||
| EPVKTEMGPP | PSPASTCSDA | SSIASSASMP | YKRRRSTPAP | KEEEKVNEEQ | ||||
| WSLREVVFVE | DVKNVPVGKV | LKVDGAYVAV | KFPGTSSNTN | CQNSSGPDAD | ||||
| PSSLLQDCRL | LRIDELQVVK | TGGTPKVPDC | FQRTPKKLCI | PEKTEILAVN | ||||
| VDSKGVHAVL | KTGNWVRYCI | FDLATGKAEQ | ENNFPTSSIA | FLGQNERNVA | ||||
| IFTAGQESPI | ILRDGNGTIY | PMAKDCMGGI | RDPDWLDLPP | ISSLGMGVHS | ||||
| LINLPANSTI | KKKAAVIIMA | VEKQTLMQHI | LRCDYEACRQ | YLMNLEQAVV | ||||
| LEQNLQMLQT | FISHRCDGNR | NILHACVSVC | FPTSNKETKE | EEEAERSERN | ||||
| TFAERLSAVE | AIANAISVVS | SNGPGNRAGS | SSSRSLRLRE | MMRRSLRAAG | ||||
| LGRHEAGASS | SDHQDPVSPP | IAPPSWVPDP | PAMDPDGDID | FILAPAVGSL | ||||
| TTAATGTGQG | PSTSTIPGPS | TEPSVVESKD | RKANAHFILK | LLCDSVVLQP | ||||
| YLRELLSAKD | ARGMTPFMSA | VSGRAYPAAI | TILETAQKIA | KAEISSSEKE | ||||
| EDVFMGMVCP | SGTNPDDSPL | YVLCCNDTCS | FTWTGAEHIN | QDIFECRTCG | ||||
| LLESLCCCTE | CARVCHKGHD | CKLKRTSPTA | YCDCWEKCKC | KTLIAGQKSA | ||||
| RLDLLYRLLT | ATNLVTLPNS | RGEHLLLFLV | QTVARQTVEH | CQYRPPRIRE | ||||
| DRNRKTASPE | DSDMPDHDLE | PPRFAQLALE | RVLQDWNALK | SMIMFGSQEN | ||||
| KDPLSASSRI | GHLLPEEQVY | LNQQSGTIRL | DCFTHCLIVK | CTADILLLDT | ||||
| LLGTLVKELQ | NKYTPGRREE | AIAVTMRFLR | SVARVFVILS | VEMASSKKKN | ||||
| NFIPQPIGKC | KRVFQALLPY | AVEELCNVAE | SLIVPVRMGI | ARPTAPFTLA | ||||
| STSIDAMQGS | EELFSVEPLP | PRPSSDQSSS | SSQSQSSYII | RNPQQRRISQ | ||||
| SQPVRGRDEE | QDDIVSADVE | EVEVVEGVAG | EEDHHDEQEE | HGEENAEAEG | ||||
| QHDEHDEDGS | DMELDLLAAA | ETESDSESNH | SNQDNASGRR | SVVTAATAGS | ||||
| EAGASSVPAF | FSEDDSQSND | SSDSDSSSSQ | SDDIEQETFM | LDEPLERTTN | ||||
| SSHANGAAQA | PRSMQWAVRN | TQHQRAASTA | PSSTSTPAAS | SAGLIYIDPS | ||||
| NLRRSGTIST | SAAAAAAALE | ASNASSYLTS | ASSLARAYSI | VIRQISDLMG | ||||
| LIPKYNHLVY | SQIPAAVKLT | YQDAVNLQNY | VEEKLIPTWN | WMVSIMDSTE | ||||
| AQLRYGSALA | SAGDPGHPNH | PLHASQNSAR | RERMTAREEA | SLRTLEGRRR | ||||
| ATLLSARQGM | MSARGDFLNY | ALSLMRSHND | EHSDVLPVLD | VCSLKHVAYV | ||||
| FQALIYWIKA | MNQQTTLDTP | QLERKRTREL | LELGIDNEDS | EHENDDDTNQ | ||||
| SATLNDKDDD | SLPAETGQNH | PFFRRSDSMT | FLGCIPPNPF | EVPLAEAIPL | ||||
| ADQPHLLQPN | ARKEDLFGRP | SQGLYSSSAS | SGKCLMEVTV | DRNCLEVLPT | ||||
| KMSYAANLKN | VMNMQNRQKK | EGEEQPVLPE | ETESSKPGPS | AHDLAAQLKS | ||||
| SLLAEIGLTE | SEGPPLTSFR | PQCSFMGMVI | SHDMLLGRWR | LSLELFGRVF | ||||
| MEDVGAEPGS | ILTELGGFEV | KESKFRREME | KLRNQQSRDL | SLEVDRDRDL | ||||
| LIQQTMRQLN | NHFGRRCATT | PMAVHRVKVT | FKDEPGEGSG | VARSFYTAIA | ||||
| QAFLSNEKLP | NLECIQNANK | GTHTSLMQRL | RNRGERDRER | EREREMRRSS | ||||
| GLRAGSRRDR | DRDFRRQLSI | DTRPFRPASE | GNPSDDPEPL | PAHRQALGER | ||||
| LYPRVQAMQP | AFASKITGML | LELSPAQLLL | LLASEDSLRA | RVDEAMELII | ||||
| AHGRENGADS | ILDLGLVDSS | EKVQQENRKR | HGSSRSVVDM | DLDDTDDGDD | ||||
| NAPLFYQPGK | RGFYTPRPGK | NTEARLNCFR | NIGRILGLCL | LQNELCPITL | ||||
| NRHVIKVLLG | RKVNWHDFAF | FDPVMYESLR | QLILASQSSD | ADAVFSAMDL | ||||
| AFAIDLCKEE | GGGQVELIPN | GVNIPVTPQN | VYEYVRKYAE | HRMLVVAEQP | ||||
| LHAMRKGLLD | VLPKNSLEDL | TAEDFRLLVN | GCGEVNVQML | ISFTSFNDES | ||||
| GENAEKLLQF | KRWFWSIVEK | MSMTERQDLV | YFWTSSPSLP | ASEEGFQPMP | ||||
| SITIRPPDDQ | HLPTANTCIS | RLYVPLYSSK | QILKQKLLLA | IKTKNFGFV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Maddika S., Chen J. (2009). Protein kinase DYRK2 is a scaffold that facilitates assembly of an E3 ligase. Nat. Cell Biol. 11: 409—419. PMID 19287380 doi:10.1038/ncb1848
- Bethard J.R., Zheng H., Roberts L., Eblen S.T. (2011). Identification of phosphorylation sites on the E3 ubiquitin ligase UBR5/EDD. J. Proteomics. 75: 603—609. PMID 21924388 doi:10.1016/j.jprot.2011.08.023
- Deo R.C., Sonenberg N., Burley S.K. (2001). X-ray structure of the human hyperplastic discs protein: an ortholog of the C-terminal domain of poly(A)-binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 4414—4419. PMID 11287654 doi:10.1073/pnas.071552198
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16806 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]
- ↑ UniProt, O95071 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
