VPS28

VPS28
Ідентифікатори
Символи	VPS28, ESCRT-I subunit, VPS28 subunit of ESCRT-I
Зовнішні ІД	OMIM: 611952 MGI: 1914164 HomoloGene: 69205 GeneCards: VPS28
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0032403 protein-containing complex binding; • ubiquitin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • ендосома; • мембрана; • late endosome membrane; • клітинна мембрана; • early endosome; • endosome membrane; • екзосома; • ESCRT I complex; • host cell;
Біологічний процес	• GO:0046795 intracellular transport of virus; • positive regulation of ubiquitin-dependent endocytosis; • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process; • viral budding via host ESCRT complex; • GO:0019067 viral life cycle; • multivesicular body assembly; • endosomal transport; • negative regulation of protein ubiquitination; • protein transport; • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • macroautophagy; • GO:0015915 транспорт; • endosome transport via multivesicular body sorting pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51160
	66914
	ENSG00000160948; ENSG00000285339
	ENSMUSG00000115987
	Q9UK41; Q548N1
	Q9D1C8
	NM_016208; NM_183057
	NM_025842; NM_001305668
	NP_057292; NP_898880; NP_057292.1
	NP_001292597; NP_080118
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VPS28 (англ. VPS28, ESCRT-I subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 25 425^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFHGIPATPG	IGAPGNKPEL	YEEVKLYKNA	REREKYDNMA	ELFAVVKTMQ
ALEKAYIKDC	VSPSEYTAAC	SRLLVQYKAA	FRQVQGSEIS	SIDEFCRKFR
LDCPLAMERI	KEDRPITIKD	DKGNLNRCIA	DVVSLFITVM	DKLRLEIRAM
DEIQPDLREL	METMHRMSHL	PPDFEGRQTV	SQWLQTLSGM	SASDELDDSQ
VRQMLFDLES	AYNAFNRFLH	A

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bishop N., Horman A., Woodman P. (2002). Mammalian class E vps proteins recognize ubiquitin and act in the removal of endosomal protein-ubiquitin conjugates. J. Cell Biol. 157: 91—101. PMID 11916981 doi:10.1083/jcb.200112080
Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 doi:10.1016/j.devcel.2008.04.004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18178 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UK41 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18178 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9UK41 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]