XAF1

XAF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LXW
Ідентифікатори
Символи	XAF1, BIRC4BP, HSXIAPAF1, XIAPAF1, XIAP associated factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606717 MGI: 3772572 HomoloGene: 49488 GeneCards: XAF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • zinc ion binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • цитоплазма; • клітинне ядро; • мітохондрія;
Біологічний процес	• GO:0097285 апоптоз; • type I interferon signaling pathway; • response to interferon-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	54739
	327959
	ENSG00000132530
	ENSMUSG00000040483
	Q6GPH4
	Q5NBU8
NM_017523; NM_199139; NM_001353134; NM_001353135; NM_001353136;
	NM_001353137; NM_001353138; NM_001353139; NM_001353140
	NM_001037713; NM_001291153
NP_059993; NP_954590; NP_001340063; NP_001340064; NP_001340065;
	NP_001340066; NP_001340067; NP_001340068; NP_001340069
	NP_001032802; NP_001278082
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

XAF1 (англ. XIAP associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 34 626^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGDFSVCRN	CKRHVVSANF	TLHEAYCLRF	LVLCPECEEP	VPKETMEEHC
KLEHQQVGCT	MCQQSMQKSS	LEFHKANECQ	ERPVECKFCK	LDMQLSKLEL
HESYCGSRTE	LCQGCGQFIM	HRMLAQHRDV	CRSEQAQLGK	GERISAPERE
IYCHYCNQMI	PENKYFHHMG	KCCPDSEFKK	HFPVGNPEIL	PSSLPSQAAE
NQTSTMEKDV	RPKTRSINRF	PLHSESSSKK	APRSKNKTLD	PLLMSEPKPR
TSSPRGDKAA	YDILRRCSQC	GILLPLPILN	QHQEKCRWLA	SSKGKQVRNF
S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yin W., Cheepala S., Clifford J.L. (2006). Identification of a novel splice variant of X-linked inhibitor of apoptosis-associated factor 1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339: 1148—1154. PMID 16343440 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.11.128
Xia Y., Novak R., Lewis J., Duckett C.S., Phillips A.C. (2006). Xaf1 can cooperate with TNFalpha in the induction of apoptosis, independently of interaction with XIAP. Mol. Cell. Biochem. 286: 67—76. PMID 16432762 DOI:10.1007/s11010-005-9094-2

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30932 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-13 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q6GPH4 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30932 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-13 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q6GPH4 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]