DBP
DBP
Ідентифікатори
Символи
DBP , DABP, D-box binding PAR bZIP transcription factor, taxREB302
Зовнішні ІД
OMIM : 124097 MGI: 94866 HomoloGene: 1035 GeneCards: DBP
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • liver development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ритмічний процес • циркадний ритм • multicellular organism development • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 48.63 – 48.64 Mb
Хр. 7: 45.35 – 45.36 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
DBP (англ. D-box binding PAR bZIP transcription factor ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот , а молекулярна маса — 34 349[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MARPVSDRTP APLLLGGPAG TPPGGGALLG LRSLLQGTSK PKEPASCLLK
EKERKAALPA ATTPGPGLET AGPADAPAGA VVGGGSPRGR PGPVPAPGLL
APLLWERTLP FGDVEYVDLD AFLLEHGLPP SPPPPGGPSP EPSPARTPAP
SPGPGSCGSA SPRSSPGHAP ARAALGTASG HRAGLTSRDT PSPVDPDTVE
VLMTFEPDPA DLALSSIPGH ETFDPRRHRF SEEELKPQPI MKKARKIQVP
EEQKDEKYWS RRYKNNEAAK RSRDARRLKE NQISVRAAFL EKENALLRQE
VVAVRQELSH YRAVLSRYQA QHGAL
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Література
Khatib Z.A., Inaba T., Valentine M., Look A.T. (1994). Chromosomal localization and cDNA cloning of the human DBP and TEF genes. Genomics . 23 : 344—351. PMID 7835883 doi :10.1006/geno.1994.1510
Shutler G., Glassco T., Kang X., Korneluk R., Mueller C.R. (1996). Genomic structure of the human D-site binding protein (DBP) gene. Genomics . 34 : 334—339. PMID 8786133 doi :10.1006/geno.1996.0295
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Brown S.A., Schibler U. (1999). The ins and outs of circadian timekeeping. Curr. Opin. Genet. Dev . 9 : 588—594. PMID 10508692 doi :10.1016/S0959-437X(99)00009-X
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші
The article is a derivative under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License .
A link to the original article can be found here and attribution parties here
By using this site, you agree to the Terms of Use . Gpedia ® is a registered trademark of the Cyberajah Pty Ltd