GABRR1

GABRR1
Ідентифікатори
Символи	GABRR1, gamma-aminobutyric acid type A receptor rho1 subunit, gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit rho1
Зовнішні ІД	OMIM: 137161 MGI: 95625 HomoloGene: 20470 GeneCards: GABRR1
Реагує на сполуку
	isoguvacine, Мусцимол, gaboxadol, isonipecotic acid, picrotoxin
Онтологія гена
Молекулярна функція	• chloride channel activity; • extracellular ligand-gated ion channel activity; • GABA-A receptor activity; • ion channel activity; • transmembrane signaling receptor activity; • ligand-gated ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential; • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • GABA-A receptor complex; • postsynaptic membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • синапс; • integral component of plasma membrane; • chloride channel complex; • міжклітинні контакти; • neuron projection; • glutamatergic synapse; • GABA-ergic synapse;
Біологічний процес	• gamma-aminobutyric acid signaling pathway; • chloride transmembrane transport; • ion transport; • chloride transport; • chemical synaptic transmission; • ion transmembrane transport; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • regulation of membrane potential; • nervous system process; • regulation of postsynaptic membrane potential; • regulation of presynaptic membrane potential;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2569
	14408
	ENSG00000146276
	ENSMUSG00000028280
	P24046
	P56475
	NM_001256703; NM_001256704; NM_001267582; NM_002042
	NM_008075
	NP_001243632; NP_001243633; NP_001254511; NP_002033
	NP_032101
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GABRR1 (англ. Gamma-aminobutyric acid type A receptor rho1 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 55 883^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLAVPNMRFG	IFLLWWGWVL	ATESRMHWPG	REVHEMSKKG	RPQRQRREVH
EDAHKQVSPI	LRRSPDITKS	PLTKSEQLLR	IDDHDFSMRP	GFGGPAIPVG
VDVQVESLDS	ISEVDMDFTM	TLYLRHYWKD	ERLSFPSTNN	LSMTFDGRLV
KKIWVPDMFF	VHSKRSFIHD	TTTDNVMLRV	QPDGKVLYSL	RVTVTAMCNM
DFSRFPLDTQ	TCSLEIESYA	YTEDDLMLYW	KKGNDSLKTD	ERISLSQFLI
QEFHTTTKLA	FYSSTGWYNR	LYINFTLRRH	IFFFLLQTYF	PATLMVMLSW
VSFWIDRRAV	PARVPLGITT	VLTMSTIITG	VNASMPRVSY	IKAVDIYLWV
SFVFVFLSVL	EYAAVNYLTT	VQERKEQKLR	EKLPCTSGLP	PPRTAMLDGN
YSDGEVNDLD	NYMPENGEKP	DRMMVQLTLA	SERSSPQRKS	QRSSYVSMRI
DTHAIDKYSR	IIFPAAYILF	NLIYWSIFS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504