MBD1

MBD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IG4, 1D9N, 4D4W
Ідентифікатори
Символи	MBD1, CXXC3, PCM1, RFT, methyl-CpG binding domain protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 156535 MGI: 1333811 HomoloGene: 8414 GeneCards: MBD1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • double-stranded methylated DNA binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • methyl-CpG binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• nuclear speck; • nuclear matrix; • хромосома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4152
	17190
	ENSG00000141644
	ENSMUSG00000024561
	Q9UIS9
	Q9Z2E2
NM_001204136; NM_001204137; NM_001204138; NM_001204139; NM_001204140;
	NM_001204141; NM_001204142; NM_001204143; NM_001204151; NM_002384; NM_015844; NM_015845; NM_015846; NM_015847; NM_001323942; NM_001323947; NM_001323949; NM_001323950; NM_001323951; NM_001323952; NM_001323953; NM_001323954
	NM_013594; NM_001357421; NM_001357422; NM_001357423
NP_001191065; NP_001191066; NP_001191067; NP_001191068; NP_001191069;
	NP_001191070; NP_001191071; NP_001191072; NP_001191080; NP_001310871; NP_001310876; NP_001310878; NP_001310879; NP_001310880; NP_001310881; NP_001310882; NP_001310883; NP_002375; NP_056669; NP_056670; NP_056671; NP_056723
NP_038622; NP_001344350; NP_001344351; NP_001344352; NP_001389818;
	NP_001389819; NP_001389820; NP_001389821; NP_001389823; NP_001389824
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MBD1 (англ. Methyl-CpG binding domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 66 607^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEDWLDCPA	LGPGWKRREV	FRKSGATCGR	SDTYYQSPTG	DRIRSKVELT
RYLGPACDLT	LFDFKQGILC	YPAPKAHPVA	VASKKRKKPS	RPAKTRKRQV
GPQSGEVRKE	APRDETKADT	DTAPASFPAP	GCCENCGISF	SGDGTQRQRL
KTLCKDCRAQ	RIAFNREQRM	FKRVGCGECA	ACQVTEDCGA	CSTCLLQLPH
DVASGLFCKC	ERRRCLRIVE	RSRGCGVCRG	CQTQEDCGHC	PICLRPPRPG
LRRQWKCVQR	RCLRGKHARR	KGGCDSKMAA	RRRPGAQPLP	PPPPSQSPEP
TEPHPRALAP	SPPAEFIYYC	VDEDELQPYT	NRRQNRKCGA	CAACLRRMDC
GRCDFCCDKP	KFGGSNQKRQ	KCRWRQCLQF	AMKRLLPSVW	SESEDGAGSP
PPYRRRKRPS	SARRHHLGPT	LKPTLATRTA	QPDHTQAPTK	QEAGGGFVLP
PPGTDLVFLR	EGASSPVQVP	GPVAASTEAL	LQEAQCSGLS	WVVALPQVKQ
EKADTQDEWT	PGTAVLTSPV	LVPGCPSKAV	DPGLPSVKQE	PPDPEEDKEE
NKDDSASKLA	PEEEAGGAGT	PVITEIFSLG	GTRFRDTAVW	LPRSKDLKKP
GARKQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Cross S.H., Meehan R.R., Nan X., Bird A. (1997). A component of the transcriptional repressor MeCP1 shares a motif with DNA methyltransferase and HRX proteins. Nat. Genet. 16: 256—259. PMID 9207790 doi:10.1038/ng0797-256
Andersen J.B., Strandbygaard D.J., Hartmann R., Justesen J. (2004). Interaction between the 2'-5' oligoadenylate synthetase-like protein p59 OASL and the transcriptional repressor methyl CpG-binding protein 1. Eur. J. Biochem. 271: 628—636. PMID 14728690 doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03966.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins. Mol. Cell. Biol. 18: 6538—6547. PMID 9774669 doi:10.1128/MCB.18.11.6538
Ng H.-H., Jeppesen P., Bird A. (2000). Active repression of methylated genes by the chromosomal protein MBD1. Mol. Cell. Biol. 20: 1394—1406. PMID 10648624 doi:10.1128/MCB.20.4.1394-1406.2000
Reese B.E., Bachman K.E., Baylin S.B., Rountree M.R. (2003). The methyl-CpG binding protein MBD1 interacts with the p150 subunit of chromatin assembly factor 1. Mol. Cell. Biol. 23: 3226—3236. PMID 12697822 doi:10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6916 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UIS9 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6916 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{cite web}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9UIS9 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]